Auteur/autrice : m4rsu
Ses publications :
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LaTeX : automatisez le traitement des CSV
Vous avez peut-être vu l'excellent article de Chopopope sur l'utilisation des flottants en LaTeX, et en particulier la partie sur la création de tableaux. Non ? Pour les retardataires, c'est par ici… Vous vous êtes surement rendu compte que créer des tableaux peut être long et fastidieux. De plus, en bons bioinformaticiens, vos données tabulées sont…
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Questions à… Jean-Marc Victor
Retranscription de la Table Ouverte en bioinformatique (TOBi) du mois d'avril 2017 avec Jean-Marc Victor, directeur de recherche CNRS au LPTMC et responsable du GdR ADN. Pouvez-vous vous présenter ? Jean-Marc Victor : Je ne suis pas bioinformaticien. Je suis un peu bio, mais pas trop informaticien. Et je suis physicien. Et il parait que c'est la première…
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Séquençage : pas de nouveauté depuis les années 70 ?
Oui, on sait, vous les Geekus biologicus vous avez du être attirés par ce titre en vous disant qu'on est complètement ravagés. Évidemment qu'il y a de la nouveauté en matière de séquençage ! Apparemment tout le monde n'est pas au courant. En effet, le 9 février, (au moins) deux articles, publiés dans des journaux grands…
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Questions à… Julien Maupetit
M4rsu : Bonjour Julien (très beau prénom !) et merci d'avoir accepté de te prêter à cet exercice. Pour commencer pourrais-tu te présenter rapidement pour nos lecteurs ? Julien : Bonjour. En quelques mots, j'ai eu un parcours universitaire assez classique : après deux premières années de médecine, une année de tristesse en équivalence de DEUG de bio, j'ai…
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Dessiner des molécules avec LaTeX
Vous avez surement déjà entendu un barbu vous dire "Tu vas voir LaTeX c'est génial, tu peux même dessiner des molécules avec !". Et du coup vous vous êtes dit que c'est vrai que ça a l'air bien vu qu'on peut même dessiner des molécules avec ! Et effectivement, on peut ! La molécule suivante a été…
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Aux origines de la bioinformatique
Pour changer des tutoriels et des perspectives sur l’avenir de la bioinformatique, je vous propose aujourd’hui un retour aux sources. En effet, nous allons voir comment est née la bioinformatique. Nolwenn vous en avait déjà parlé ici, mais plus d'un point de vue méthodologique. S’interroger sur les origines de la bioinformatique nous permettra de répondre (ou…
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3D XPoint : une nouvelle technologie de stockage
Vous n'avez pas encore équipé votre ordinateur de SSD ? Et bien vous pouvez abandonner le projet… En effet Intel, en partenariat avec Micron, a présenté le 28 juillet une nouvelle technologie de stockage 3D XPoint (prononcez trois dés ixe point three di cross point). 3D XPoint est bien plus rapide que le stockage flash équipant les SSD, mais…
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Les 10 ans de la SFBI
C'est une info passée un peu inaperçue et pourtant… La Société Française de Bioinformatique (SFBI) fête, cette année, ses 10 années d'existence ! Et oui, déjà ! Bon anniversaire à elle ! ♫ Joyeux anniversaire, Joyeux anniversaire la SFBI etc. ♫ Pour fêter ses 10 ans, la SFBI veut changer son identité visuelle et dans un premier…
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Créer sa carte géographique avec R
Aujourd’hui je vais vous montrer comment, en utilisant R, on peut faire de belles cartes géographiques. Et là, vous allez me demander, mais pourquoi faire des cartes géographique ? Et pourquoi avec R ? Et bien imaginons que, vous, bioinformaticien de terrain, soyez allé échantillonner des animaux à l’autre bout du monde sur plusieurs sites, par exemple…