Auteur/autrice : Pierre Marijon
Ses publications :
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Les mystérieuses cités d'or
La bioinformatique est un domaine de recherche donc, avec régulièrement de nouveaux logiciels et très souvent* votre premier contact avec ce nouveau logiciel se fait via la forge logiciel GitHub. Sur GitHub la première chose que l'utilisateur voit c'est le Readme (pour plus de détails sur ce fichier aller lire cet excellent billet de blog).…
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Qu'est-ce qu'un bon fichier Lisez-moi.txt
Vous venez de finir votre outil sur lequel vous travaillez depuis 1 semaine/1 mois/1 an/10 ans (rayez la mention inutile) qui va révolutionner votre domaine. Votre code est versionné, formaté, commenté, documenté, testé, les résultats sont évalués selon le gold standard de la discipline sur des jeux de données représentatifs de la réalité, votre publication…
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Pourquoi vous avez besoin d'un blog scientifique !
Mon titre étant volontairement provocateur je vais commencer par le modérer et l'expliquer. Vous n'avez pas forcément besoin de votre blog, vous avez besoin d'un espace ou vous pouvez écrire des textes structurés avec des tableaux, des images et la possibilité de les rendre publics facilement. Un dépôt Github comme un compte Twitter peuvent ainsi…
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Eh toi ! rev_comp, tu l'écris comment ?
Écrire un algorithme de rev_comp ou complément inverse, on l'a tous déjà fait. Aujourd'hui c'est devenu un classique des cours d'algorithmique en étude de bioinformatique, c'est un algorithme simple mais qui demande de savoir utiliser les structures de contrôle de base. À la fois un bon exercice pratique et pédagogique, doit-il cependant rester implémenté comme…
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Une licence ? Pour quoi faire…
Cet article ne parle pas de la formation universitaire, ni des obligations des débits de boisson. Mais du petit texte qu'on vous demande de lire avant d'installer un logiciel ou qu'on cite en bas des pages des sites internet. Pour vous faire gagner du temps, voici, par exemple, ce que vous trouverez en bas…