Étiquette : Métagénomique

  • La bio-informatique au service de l’antibiorésistance

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    par

    Gwenaelle
    dans
    La bio-informatique au service de l’antibiorésistance

    En ces temps hiver­naux, virus et infec­tions bac­té­riennes sont de retour (pour vous jouer un mau­vais tour…). Les cam­pagnes de pré­ven­tion et de soin sont donc de sor­tie, et par­mi elles la célèbre : "Les anti­bio­tiques, c'est pas auto­ma­tique". Si ce slo­gan est bien ren­tré dans la tête des gens, la rai­son pour laquelle il a…

  • Compareads et Commet

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    par

    Nico M.
    dans
    Compareads et Commet

    Après vous avoir par­lé de Méta­gé­no­mique et de filtre de Bloom, voi­ci un article fusion­nant les deux concepts en un algo­rithme ! Pour rap­pel, la méta­gé­no­mique vise à étu­dier le conte­nu géné­tique et géno­mique d'un milieu don­né. On passe géné­ra­le­ment par un séquen­çage NGS et on récu­père un grand nombre de courtes séquences d'ADN (lec­tures, ou…

  • Métagénomique et Graphique de Recrutement : chercher l'aiguille dans la botte de foin !

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    par

    NiGoPol
    dans
    Métagénomique et Graphique de Recrutement : chercher l'aiguille dans la botte de foin !

    Un inté­rêt cer­tain se déve­loppe pour la com­pré­hen­sion d'écosystèmes com­plexes comme les eaux, les sols ou encore les micro­biomes (plus de 90% des cel­lules du corps humain sont en fait les bac­té­ries qui peuplent son tube diges­tif). Plu­sieurs dif­fi­cul­tés se posent : la plu­part des orga­nismes pré­sents ne sont pas faci­le­ment culti­vables et donc indi­vi­dua­li­sables. tous…

  • La métagénomique et les défis pour la bioinformatique au goût #IHMC2012

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    par

    Malicia
    dans
    La métagénomique et les défis pour la bioinformatique au goût #IHMC2012

    On vous avait dit il y a peu qu'on allait vous par­ler du Congrès inter­na­tio­nal sur le micro­biome humain (Inter­na­tio­nal Human Micro­biome Congress 2012). Pour quelques rai­sons, votre humble ser­vi­teure a tar­dé avec son for­fait. Mais voi­ci que c'est main­te­nant chose faite : nous espé­rons que la frus­tra­tion sera vite oubliée 😉 Je vous avais déjà…

  • Exclusif : Bioinfo-fr au Congrès sur le microbiome humain #IHMC2012

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    par

    Malicia
    dans ,

    Le Congrès inter­na­tio­nal sur le micro­biome humain 2012 (Inter­na­tio­nal Human Micro­biome Congress 2012) a com­men­cé hier, le 19 mars 2012, au Palais Bron­gniart à Paris. Bioin­fo-fr était pré­sent, évi­dem­ment 😉 Voi­ci une petite mise en bouche. Qu'est-ce que le microbiome humain ? Il s'agit de l'ensemble de la flore bac­té­rienne du corps humain. Lorsque l'on parle…

  • Métagénomique : différences fondamentales avec la génomique

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    par

    Nico M.
    dans
    Métagénomique : différences fondamentales avec la génomique

    Qu'est ce que la métagénomique ?  Depuis quelques années, la méta­gé­no­mique semble s'installer de plus en plus par­mi les sciences du vivant. Bien que plu­sieurs tech­niques et modi ope­ran­di se cachent der­rière le terme "méta­gé­no­mique", on peut y appo­ser une défi­ni­tion géné­rale : la méta­gé­no­mique vise à étu­dier l'ensemble des génomes issus d'un même milieu ain­si que…