Après avoir discuté des alignements multiples (MSA), il s’avérait logique de vous présenter l’étape suivante : la construction d’ arbres phylogénétiques . Je précise que je ne parlerai ici que de phylogénie moléculaire .
Le but de la phylogénie est de comprendre les relations de parenté , de retracer l’historique évolutif d’un gène, d’une famille de gènes ou d’une espèce. Les arbres phylogénétiques sont une très bonne manière de schématiser et d’appréhender ces relations rapidement. Leur interprétation est également assez aisée du moment que l’on connait leur nomenclature. Avant de vous expliquer celle-ci, je me pencherai donc d’abord sur comment les réaliser.