Étiquette : protéine

  • GGMM 2013 : le bilan

    —

    par

    Gophys
    dans
    GGMM 2013 : le bilan

    Votre super repor­ter s'est ren­du à deux congrès au mois de Mai, que vous avez pu suivre en direct via des live-tweets. Pour ceux qui ont raté le coche et pour les autre aus­si, voi­ci un résu­mé de ce qui s'est pas­sé durant le pre­mier congrès. GGMM, pour Groupe de Gra­phisme et Modé­li­sa­tion Molé­cu­laire, est un congrès…

  • Comment détecter, compiler et annoter des facteurs de transcription ?

    —

    par

    I. Stévant
    dans
    Comment détecter, compiler et annoter des facteurs de transcription ?

    Après la réunion de ren­trée de tous les contri­bu­teurs du blog, nous avons déci­dé d'étendre la rubrique "Jour­nal Club". Ain­si, il est désor­mais non seule­ment pos­sible mais aus­si for­te­ment recom­man­dé de pro­po­ser des billets dis­cu­tant d'un article en par­ti­cu­lier. Nous inau­gu­rons cette exten­sion avec un sujet pas­sion­nant : la détec­tion de fac­teurs de trans­crip­tion. Bonne lec­ture…

  • Les matrices de substitution

    —

    par

    Guillaume Collet
    dans
    Les matrices de substitution

    Dans les pre­miers billets de ce blog, nous avons pré­sen­té les ali­gne­ments mul­tiples de séquences d'une part du point de vue des logi­ciels et ensuite du cal­cul de la conser­va­tion. Je vous pro­pose aujourd'hui de reve­nir sur un point impor­tant : les matrices de sub­sti­tu­tion. Com­men­çons par une défi­ni­tion très simple : une matrice de sub­sti­tu­tion per­met,…

  • Une question d'équilibre

    —

    par

    Guillaume Collet
    dans
    Une question d'équilibre

    De nom­breux articles de bio­in­for­ma­tique com­mencent par une phrase du genre : "Les mul­tiples pro­jets de séquen­çage et les pro­grès tech­no­lo­giques réa­li­sés ces der­nières années per­mettent aujourd'hui de pro­duire une énorme masse de don­nées bio­lo­giques." Cette phrase sert en géné­ral à intro­duire l'utilisation d'algorithme plus rapide, le trai­te­ment en paral­lèle des don­nées, ou leur uti­li­sa­tion mas­sive afin d'extraire de…

  • La modélisation moléculaire

    —

    par

    Gophys
    dans
    La modélisation moléculaire

    La modé­li­sa­tion molé­cu­laire est un ensemble de méthodes per­met­tant d'expliquer com­ment fonc­tionne le vivant. En effet, le vivant est une suc­ces­sion d’interactions entre dif­fé­rentes molé­cules : pro­téines, ADN, ARN, mem­branes, etc. Ces molé­cules inter­agissent les unes par rap­port aux autres en fonc­tion de plu­sieurs para­mètres : leurs formes, leurs pro­prié­tés chi­miques et leur envi­ron­ne­ment. La modé­li­sa­tion molé­cu­laire per­met de pré­dire la…

  • Étude de la régulation de l'épissage alternatif

    —

    par

    I. Stévant
    dans
    Étude de la régulation de l'épissage alternatif

    Je vais vous expo­ser dans cet articles un exemple de col­la­bo­ra­tion entre bio­lo­gistes et bio­in­for­ma­ti­ciens afin de répondre à un pro­blème bio­lo­gique com­plexe : l'étude de la régu­la­tion de l'épissage alter­na­tif. Je vais vous pré­sen­ter dans un pre­mier temps le contexte bio­lo­gique, à savoir ce qu'est l'épissage et com­ment il est régu­lé. Puis je vais vous…