Assembler un génome est une tâche fastidieuse et surtout très coûteuse. Pour un génome de 100 Mbp (Million de paires de bases), Velvet ou SOAPdenovo utilisent 20 à 30 Go de mémoire, voire plus. Je voudrais partager avec vous une idée complètement farfelue qui nous est venue et qui nous a fait gagner (Guillaume Rizk et moi-même) le prix du meilleur poster lors de JOBIM 2013 : et si on faisait de l'assemblage de génome sur un Raspberry Pi ?
Raspberry Pi (CC-BY-SA 3...
