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IA et analyse des génomes : une autre révolution en cours ? (partie 1)

17 juin 2026

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par

Gaëlle Lelandais

dans Bioinformatique, Découverte, Opinion

Cher·es toutes et tous ! À chaque fois que je parcours ce blog, je me dis : « Ouah, c'est génial de prendre le temps, ainsi, de partager ses idées et ses savoir-faire, mais pourquoi est-ce que je ne le fais pas plus souvent ? ». Ma dernière (et unique !) contribution date en effet de 2021. Cela fait […]
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Le « vibe coding » est un piège

27 mai 2026

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par

Évoluscope

dans Bioinformatique, Opinion

Aujourd'hui, je change un peu de registre : pour une fois je ne vais pas vous expliquer un concept technique mais partager mon avis sur un sujet qui me tient à cœur. Inutile de ménager le suspense, le titre est assez transparent. Pour ceux qui ne connaitraient pas, le « vibe coding » (qu'on peut franciser en « programmation […]
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La fin du génome linéaire : Bienvenue dans l'ère (complexe) du Pangénome

7 mai 2026

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par

Lee Mariault

dans Bioinformatique, Découverte

Que vous soyez bio-informaticien aguerri, étudiant en master ou simplement curieux ayant déjà manipulé un fichier FASTA un jour dans votre vie, ce billet de blog est pour vous. Nous allons explorer pourquoi et comment nos repères actuels en génomique sont en train de changer de forme. Le génome de référence classique Prenons l'exemple du […]
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Le changement de mentalité en passant en R&D

29 avril 2026

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par

Léopold Carron

dans Opinion

Mes très chers amis, mes bien-aimés collègues, les autres, comme vous le savez j’adore écrire des articles d’opinion sur ce blog sur tout ce qui nous concerne. Ici j’aimerais évoquer des exemples de ce qui a changé concrètement dans ma manière de penser professionnellement. En passant de chercheur en contrat postdoctoral à data scientist en […]
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La complexité inattendue des systèmes de coordonnées en bioinformatique

10 décembre 2025

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par

Jacques Dainat

dans Bioinformatique, Découverte

En bioinformatique, quand on manipule des génomes, des annotations, des fichiers d’alignement, des variants ou des intervalles (exons, régions régulatrices, etc.), on est rapidement confronté à deux notions fondamentales qui conditionnent la manière dont les positions sont décrites et interprétées : Ces deux dimensions définissent ensemble le système de coordonnées utilisé. Les maîtriser permet d’interpréter correctement […]
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Trois exemples concrets qui m'ont fait m'intéresser à la reproductibilité entre langages

15 octobre 2025

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par

Léopold Carron

dans Bioinformatique, Découverte

Mes très chers confrères adorés, Comme vous le savez si vous lisez mes excellents articles d'opinion, tous géniaux (hum !), cela fait quelques années maintenant que je travaille pour des toxicologues. Alors, c'est bien, j'ai appris plein de choses, au point de me définir aujourd'hui comme « computational toxicologist ». Mais j'ai surtout mis mon nez dans […]
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L'alignement multiple en étoile ⭐

8 octobre 2025

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par

Évoluscope

dans Bioinformatique, Découverte

Introduction Dans le domaine de la bioinformatique l'alignement de séquences est une opération courante pour comparer des séquences biologiques (ADN, ARN, protéines). Nous avons vu dans un précédent article le principe de l'algorithme de Needleman-Wunsch qui produit un alignement global optimal de deux séquences. Au-delà de l'alignement par paire, l'alignement multiple de séquences (Multiple Sequence […]
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Bonne rentrée 2025 à tous 🎓

27 août 2025

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par

Les admin·e·s

dans Brèves, Editorial

À tous les p'tits veinards qui ont profité de vacances cet été 🌴— et aux autres aussi — on vous souhaite une belle rentrée 🎓. C’est cette période de l’année où l’on prend un nouvel élan : on planifie, on se projette, on fixe de nouveaux objectifs. Peut-être un nouveau poste pour certains, une formation pour […]
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