• La fin du génome linéaire : Bienvenue dans l'ère (complexe) du Pangénome

  7 mai 2026

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  par

  Lee Mariault

  dans Bioinformatique, Découverte

  

  Que vous soyez bio-​informaticien aguerri, étudiant en master ou simplement curieux ayant déjà manipulé un fichier FASTA un jour dans votre vie, ce billet de blog est pour vous. Nous allons explorer pourquoi et comment nos repères actuels en génomique sont en train de changer de forme. Le génome de référence classique Prenons l'exemple du […]

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• Le changement de mentalité en passant en R&D

  29 avril 2026

  -

  par

  Léopold Carron

  dans Opinion

  

  Mes très chers amis, mes bien-​aimés collègues, les autres, comme vous le savez j’adore écrire des articles d’opinion sur ce blog sur tout ce qui nous concerne. Ici j’aimerais évoquer des exemples de ce qui a changé concrètement dans ma manière de penser professionnellement. En passant de chercheur en contrat postdoctoral à data scientist en […]

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• La complexité inattendue des systèmes de coordonnées en bioinformatique

  10 décembre 2025

  -

  par

  Jacques Dainat

  dans Bioinformatique, Découverte

  

  En bioinformatique, quand on manipule des génomes, des annotations, des fichiers d’alignement, des variants ou des intervalles (exons, régions régulatrices, etc.), on est rapidement confronté à deux notions fondamentales qui conditionnent la manière dont les positions sont décrites et interprétées : Ces deux dimensions définissent ensemble le système de coordonnées utilisé. Les maîtriser permet d’interpréter correctement […]

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• Trois exemples concrets qui m'ont fait m'intéresser à la reproductibilité entre langages

  15 octobre 2025

  -

  par

  Léopold Carron

  dans Bioinformatique, Découverte

  

  Mes très chers confrères adorés, Comme vous le savez si vous lisez mes excellents articles d'opinion, tous géniaux (hum !), cela fait quelques années maintenant que je travaille pour des toxicologues. Alors, c'est bien, j'ai appris plein de choses, au point de me définir aujourd'hui comme « computational toxicologist ». Mais j'ai surtout mis mon nez dans […]

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• L'alignement multiple en étoile ⭐

  8 octobre 2025

  -

  par

  Évoluscope

  dans Bioinformatique, Découverte

  

  Introduction Dans le domaine de la bioinformatique l'alignement de séquences est une opération courante pour comparer des séquences biologiques (ADN, ARN, protéines). Nous avons vu dans un précédent article le principe de l'algorithme de Needleman-​Wunsch qui produit un alignement global optimal de deux séquences. Au-​delà de l'alignement par paire, l'alignement multiple de séquences (Multiple Sequence […]

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• Bonne rentrée 2025 à tous 🎓

  27 août 2025

  -

  par

  Les admin·e·s

  dans Brèves, Editorial

  

  À tous les p'tits veinards qui ont profité de vacances cet été 🌴— et aux autres aussi — on vous souhaite une belle rentrée 🎓. C’est cette période de l’année où l’on prend un nouvel élan : on planifie, on se projette, on fixe de nouveaux objectifs. Peut-​être un nouveau poste pour certains, une formation pour […]

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• Licence Bio-​Informatique, Statistique et Modélisation (BISM) à Lyon 1

  9 avril 2025

  -

  par

  BISM_Lyon BISM_Lyon

  dans Formation

  

  Cet article est une mise à jour de https://​bioinfo​-fr​.net/​p​r​e​s​e​n​t​a​t​i​o​n​-​d​e​-​l​a​-​l​i​c​e​n​c​e​-​m​i​v​-​a​-​l​y​o​n-1. Cette formation pluridisciplinaire existe depuis 2010 (ex. Modélisation et Informatique du Vivant), et bénéficie de la recherche historique lyonnaise en analyses de données biologiques et notamment en biométrie et statistiques. Les aspects liés à la bioinformatique ont été renforcés à partir de 2018, en lien avec […]

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• Alignement de séquences : bien comprendre l'incontournable algorithme de Needleman-​Wunsch

  5 mars 2025

  -

  par

  Évoluscope

  dans Bioinformatique, Découverte

  

  Introduction L'analyse des séquences biologiques (ADN, ARN ou protéines) est un sujet central de la biologie moléculaire et de la bioinformatique. Dans ce cadre, chercher à savoir à quel point deux séquences sont similaires ou dissimilaires est une des questions qu'on se pose le plus souvent (par exemple dans le but d'analyser des relations phylogénétiques). […]

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