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Concours CRCN-CNRS 2025
Lire la suite : Concours CRCN-CNRS 2025Comme tous les ans, le CNRS ouvre de nouveaux postes permanents de chargé de recherche au concours, et comme chaque année, la communication autours du concours est une vraie nébuleuse. D'après l'INS2I (branche sciences informatiques du CNRS), la campagne 2025 devrait s'ouvrir ce 9 décembre et se clôturer le 8 janvier 2025 : https://www.ins2i.cnrs.fr/fr/cnrsinfo/concours-chercheurs-2025-liste-des-postes-abondes-par-cnrs-sciences-informatiques Il s'agit […]
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Les pièges mentaux à éviter pour les plus jeunes chercheurs
Lire la suite : Les pièges mentaux à éviter pour les plus jeunes chercheursAujourd'hui, j'aimerais exprimer une opinion que je ne vois pas et qui fait suite à quelques conseils données aux doctorants dans ce blog. Ce message s'adresse à tous, dans une communauté à laquelle je n'appartiens plus vraiment n'étant plus dans l'académique. Nous évoquerons ici certains clichés que j'ai entendu. Un jour on est jeune, on […]
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Le jeu de la vie — comment un jeu peut-il aider la biologie ?
Lire la suite : Le jeu de la vie — comment un jeu peut-il aider la biologie ?À la suite d'un projet réalisé durant ma deuxième année de master, et après avoir vu une excellente vidéo sur ce sujet, j'ai eu envie de partager également ce jeu, aux règles simples, créant la complexité. Ce billet n'a aucun but exhaustif et j'espère qu'il apportera de nouvelles pistes de réflexion pour de futurs chercheurs […]
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Les IA génératives ne sont pas vos amies !
Lire la suite : Les IA génératives ne sont pas vos amies !Cher journal, je t'écris pour répondre à un billet que tu as publié plus tôt. Pour le résumer avec un peu de mauvaise foi : utiliser des IA génératives, c'est trop cool. Contexte ? Je ne vais ici parler que d'IA générative, pas d'autres méthodes d'IA comme celles qui permettent de faire de la classification ou du […]
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Les Bioinformations n°39 sont là !
Lire la suite : Les Bioinformations n°39 sont là !Quelles sont les dernières actualités des communautés françaises de bioinformatique ? Vous saurez tout dans ce nouveau numéro des Bioinformations : https://www.bioinformations.fr C'est quoi déjà les Bioinformations ? Il s'agit d'une newsletter trimestrielle créée en 2012, à l'initiative de la Société Française de Bioinformatique (SFBI), l'association de Jeunes Bioinformaticiens de France (JeBiF) et nous-mêmes, le blog collaboratif Bioinfo-fr.net, […]
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Ne devenez pas un dinosaures : adoptez un copilot !
Lire la suite : Ne devenez pas un dinosaures : adoptez un copilot !Sauf si vous vivez dans une grotte, sur une planète sans ordinateur ni télévision, le terme ChatGPT doit maintenant résonner à vos oreilles comme le dernier jouet à la mode. Après avoir fait des ravages considérables dans le domaine du traitement du langage, de l'imagerie et de nombreux autres domaines, le Deep Learning est en […]
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La diversité des algorithmes de clustering
Lire la suite : La diversité des algorithmes de clusteringIntroduction Cette plante est-elle comestible ? Cet animal est-il dangereux ? Classer des choses similaires dans une même catégorie et des choses dissimilaires dans différentes catégories est une idée intuitive que les enfants pratiquent dès le plus jeune âge. On utilise ainsi le même mot, « une chaise » par exemple, pour désigner une très grande variété d’objets possédant […]
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R : Convertir des Ensembl IDs en symboles de gènes
Lire la suite : R : Convertir des Ensembl IDs en symboles de gènesLorsque l'on traite des données de RNA-seq, il arrive très souvent de se retrouver avec une matrice de quantification de l'expression des gènes (un tableau avec le nombre de reads par gène) dont le nom des gènes est représenté par leur identifiant (ou ID) de chez Ensembl (ex. : "ENSG00000128573") et non par leurs symboles […]
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