• Licence Bio-Informatique, Statistique et Modélisation (BISM) à Lyon 1

  9 avril 2025

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  par

  BISM_Lyon BISM_Lyon

  dans Formation

  

  Cet article est une mise à jour de https://​bioin​fo​-fr​.net/​p​r​e​s​e​n​t​a​t​i​o​n​-​d​e​-​l​a​-​l​i​c​e​n​c​e​-​m​i​v​-​a​-​l​y​o​n-1. Cette for­ma­tion plu­ri­dis­ci­pli­naire existe depuis 2010 (ex. Modé­li­sa­tion et Infor­ma­tique du Vivant), et béné­fi­cie de la recherche his­to­rique lyon­naise en ana­lyses de don­nées bio­lo­giques et notam­ment en bio­mé­trie et sta­tis­tiques. Les aspects liés à la bio­in­for­ma­tique ont été ren­for­cés à par­tir de 2018, en lien avec […]

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• Alignement de séquences : bien comprendre l'incontournable algorithme de Needleman-Wunsch

  5 mars 2025

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  par

  Évoluscope

  dans Bioinformatique, Découverte

  

  Introduction L'analyse des séquences bio­lo­giques (ADN, ARN ou pro­téines) est un sujet cen­tral de la bio­lo­gie molé­cu­laire et de la bio­in­for­ma­tique. Dans ce cadre, cher­cher à savoir à quel point deux séquences sont simi­laires ou dis­si­mi­laires est une des ques­tions qu'on se pose le plus sou­vent (par exemple dans le but d'analyser des rela­tions phy­lo­gé­né­tiques). […]

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• Des molécules et des données !

  26 février 2025

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  par

  Léopold Carron

  dans Découverte

  

  Vu que nous sommes sur un blog de bio-infor­ma­tique, je vous pro­pose aujourd'hui de par­ler chi­mie ! Enfin plu­tôt, ché­mo­in­for­ma­tique* et quelques notions de la façon dont une molé­cule est sto­ckée en ligne en fonc­tion des régle­men­ta­tions chi­miques et cos­mé­tiques. Je ne suis pas un expert de ce domaine, mais alors vrai­ment pas du tout. Par […]

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• Software Heritage : l'archive universelle des codes sources logiciels

  19 février 2025

  -

  par

  Pierre Poulain

  dans Bioinformatique, Découverte

  

  Dans cet article, je vous pro­pose de décou­vrir Soft­ware Heri­tage, l’archive uni­ver­selle dédiée à la col­lecte, la pré­ser­va­tion et le par­tage des codes sources logi­ciels. En 2021, je suis deve­nu ambas­sa­deur pour Soft­ware Heri­tage, c’est-à-dire repré­sen­tant de la com­mu­nau­té bio­in­for­ma­tique, dans l’infrastructure Soft­ware Heri­tage. Pourquoi archiver son code source ? Aujourd’hui, les scien­ti­fiques uti­lisent très sou­vent des […]

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• Conda et le piège de la licence Anaconda

  12 février 2025

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  par

  Jacques Dainat

  dans Actualité, Astuce, Bioinformatique

  

  Conda est appa­ru en 2012 et a été dis­tri­bué par Conti­nuum Ana­ly­tics, connue sous le nom d’Ana­con­da Inc depuis 2017. Conda est dis­tri­bué sous la licence MIT, l’une des licences open-source les plus per­mis­sives, per­met­tant aux uti­li­sa­teurs d’adopter, d’adapter et de par­ta­ger le logi­ciel presque sans res­tric­tions. Conda a été conçu pour gérer les envi­ron­ne­ments […]

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• ABSD : base de données d'anticorps non redondants et standardisés

  29 janvier 2025

  -

  par

  Nico M.

  dans Actualité, Bioinformatique, Découverte

  

  Les anti­corps (immu­no­glo­bu­lines) jouent un rôle cru­cial dans la réponse immu­ni­taire contre les menaces exté­rieures, telles les infec­tions virales. Une immu­no­glo­bu­line est com­po­sée de deux molé­cules en inter­ac­tion appe­lées chaîne légère et chaîne lourde : la com­bi­nai­son d’une chaîne légère et d’une chaîne lourde donne une immu­no­glo­bu­line (voir Figure 1). Bien que le nombre théo­rique d'immunoglobulines […]

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• Comment l'étude des intensités d'expression de gène a évolué avec les technologies de transcriptomique ?

  22 janvier 2025

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  par

  Gwenaelle

  dans Découverte

  

  Cet article est en par­tie basé sur mon intro­duc­tion de thèse [0], refor­ma­tée pour conve­nir au for­mat du blog et agré­men­tée des nou­velles infor­ma­tions pour ne pas être un simple cata­logue de connais­sances. Qu'il s'agisse du génome entier, du génome de tis­sus ou du génome de cel­lules spé­ci­fiques, l'étude de la quan­ti­té de trans­crits pro­duits, […]

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• Édito : Bioinfo-fr vous souhaite la bonne année 2025

  14 janvier 2025

  -

  par

  Les admin·e·s

  dans Editorial

  

  Chers lec­teurs, chères lec­trices, la nou­velle année com­mence, et vous avez peut-être (ou pas) pris de bonnes réso­lu­tions. La nôtre est de vous offrir la meilleure pla­te­forme de com­mu­ni­ca­tion pos­sible autours de la bioin­fo. Bioin­fo-fr existe pour vous, et vie grâce à vous, et nous vous en sommes pro­fon­dé­ment recon­nais­sants. Nous essayons de vous four­nir […]

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