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Le jeu de la vie — comment un jeu peut-il aider la biologie ?
Lire la suite : Le jeu de la vie — comment un jeu peut-il aider la biologie ?À la suite d'un projet réalisé durant ma deuxième année de master, et après avoir vu une excellente vidéo sur ce sujet, j'ai eu envie de partager également ce jeu, aux règles simples, créant la complexité. Ce billet n'a aucun but exhaustif et j'espère qu'il apportera de nouvelles pistes de réflexion pour de futurs chercheurs […]
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Les IA génératives ne sont pas vos amies !
Lire la suite : Les IA génératives ne sont pas vos amies !Cher journal, je t'écris pour répondre à un billet que tu as publié plus tôt. Pour le résumer avec un peu de mauvaise foi : utiliser des IA génératives, c'est trop cool. Contexte ? Je ne vais ici parler que d'IA générative, pas d'autres méthodes d'IA comme celles qui permettent de faire de la classification ou du […]
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Les Bioinformations n°39 sont là !
Lire la suite : Les Bioinformations n°39 sont là !Quelles sont les dernières actualités des communautés françaises de bioinformatique ? Vous saurez tout dans ce nouveau numéro des Bioinformations : https://www.bioinformations.fr C'est quoi déjà les Bioinformations ? Il s'agit d'une newsletter trimestrielle créée en 2012, à l'initiative de la Société Française de Bioinformatique (SFBI), l'association de Jeunes Bioinformaticiens de France (JeBiF) et nous-mêmes, le blog collaboratif Bioinfo-fr.net, […]
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Ne devenez pas un dinosaures : adoptez un copilot !
Lire la suite : Ne devenez pas un dinosaures : adoptez un copilot !Sauf si vous vivez dans une grotte, sur une planète sans ordinateur ni télévision, le terme ChatGPT doit maintenant résonner à vos oreilles comme le dernier jouet à la mode. Après avoir fait des ravages considérables dans le domaine du traitement du langage, de l'imagerie et de nombreux autres domaines, le Deep Learning est en […]
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La diversité des algorithmes de clustering
Lire la suite : La diversité des algorithmes de clusteringIntroduction Cette plante est-elle comestible ? Cet animal est-il dangereux ? Classer des choses similaires dans une même catégorie et des choses dissimilaires dans différentes catégories est une idée intuitive que les enfants pratiquent dès le plus jeune âge. On utilise ainsi le même mot, « une chaise » par exemple, pour désigner une très grande variété d’objets possédant […]
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R : Convertir des Ensembl IDs en symboles de gènes
Lire la suite : R : Convertir des Ensembl IDs en symboles de gènesLorsque l'on traite des données de RNA-seq, il arrive très souvent de se retrouver avec une matrice de quantification de l'expression des gènes (un tableau avec le nombre de reads par gène) dont le nom des gènes est représenté par leur identifiant (ou ID) de chez Ensembl (ex. : "ENSG00000128573") et non par leurs symboles […]
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Pause estivale
Lire la suite : Pause estivaleC'est la période des vacances aussi pour Bioinfo-fr.net ! Nous mettons en pause le blog jusqu'à la rentrée prochaine afin de faire le plein d'énergie et de vitamine D. Retrouvez-nous en septembre pour une nouvelle saison que l'on espère riche en échanges et en partages autour de la bioinformatique. Nous restons cependant actifs sur nos réseaux […]
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Dans l'antre des réseaux : Principes et perspectives dans la biologie
Lire la suite : Dans l'antre des réseaux : Principes et perspectives dans la biologieAvant d'aller plus loin sur ce billet, je souhaite préciser que je ne connais absolument pas tout sur la théorie des graphes. Ceci n'est qu'une modeste introduction, visant soit à inspirer de nouvelles idées pour de futurs articles, soit à susciter un simple "Hmmm… intéressant." chez le lecteur. Mes connaissances sont assez limitées à ce […]
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