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- Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012 -

Étiquette : bash

  • Chercher des motifs dans un fichier

    Chercher des motifs dans un fichier

    Langage : shellCommandes présentées : grep, split (succintement)Niveau : débutant Présentation de la commande grep La commande grep est disponible nativement sur la plupart des systèmes d'exploitation GNU/​Linux. La plupart des utilisateurs utilisent cette commande pour rechercher un mot ou un groupe de mots, que nous appellerons motif (pattern en anglais), dans un fichier texte. Cependant cette commande…

  • Astuce : ajouter des options dans un script Bash avec getopt

    Astuce : ajouter des options dans un script Bash avec getopt

    But : comprendre le fonctionnement de getopt en Bash pour éviter la multiplications de script là où un seul générique pourrait suffire. Prérequis : savoir faire des scripts Bash, connaître la substitution de commande et savoir manipuler les arguments. Difficulté : 2 (moyen) Pour ceux qui codent en Perl, vous connaissez déjà sûrement le module GetOpt et plus…