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Catégorie : Astuce

  • Dans l'antre des réseaux : Principes et perspectives dans la biologie

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    par

    Ista
    dans , ,
    Dans l'antre des réseaux : Principes et perspectives dans la biologie

    Avant d'aller plus loin sur ce billet, je sou­haite pré­ci­ser que je ne connais abso­lu­ment pas tout sur la théo­rie des graphes. Ceci n'est qu'une modeste intro­duc­tion, visant soit à ins­pi­rer de nou­velles idées pour de futurs articles, soit à sus­ci­ter un simple "Hmmm… inté­res­sant." chez le lec­teur. Mes connais­sances sont assez limi­tées à ce…

  • R : représenter des genomic tracks avec Gviz

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    par

    ZaZo0o
    dans ,
    R : représenter des genomic tracks avec Gviz

    Si vous ana­ly­sez des don­nées d'épigénomique telles que de l'ATAC-seq ou des ChIP-seq, vous sou­hai­tez sûre­ment pou­voir repré­sen­ter des exemples de pics sous forme de geno­mic tracks comme on en voit sou­vent dans les publi­ca­tions. Lorsque l'on ins­pecte ses don­nées de cove­rage (ou cou­ver­ture), on charge géné­ra­le­ment le fichier Bam ou le fichier Big­Wig dans…

  • Synchronisez vos PDF Zotero sur Android

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    par

    ZaZo0o
    dans ,
    Synchronisez vos PDF Zotero sur Android

    [Update 06/​2024] Une appli­ca­tion Android offi­cielle est en Bêta Test : https://​play​.google​.com/​s​t​o​r​e​/​a​p​p​s​/​d​e​t​a​i​l​s​?​i​d​=​o​r​g​.​z​o​t​e​r​o​.​a​n​d​r​o​i​d​&​h​l​=fr Après un an d'errance, j'ai enfin réus­si à syn­chro­ni­ser ma col­lec­tion d'articles en PDF entre mon pc et ma liseuse, et sur­tout les anno­ta­tions faites depuis ma liseuse. Bon, j'avais lâché l'affaire pen­dant long­temps, mais un mes­sage de @sebgra sur notre ser­veur Dis­cord m'a…

  • Organiser une conférence en ligne : trucs et astuces

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    par

    Léopold Carron
    dans , ,
    Organiser une conférence en ligne : trucs et astuces

    Orga­ni­ser une confé­rence est com­plexe. Mais orga­ni­ser une confé­rence en ligne… c'est TRÈS com­plexe. Si l'ordinateur qui dif­fuse la confé­rence plante… com­ment pré­ve­nir l'audience ? La moindre erreur tech­nique fait d'avantage peur car il devient plus dif­fi­cile de rebon­dir et d’expliquer l'issue à la 'salle'. Aujourd'hui je vous pro­pose un par­tage de toutes les stra­té­gies envi­sa­gées pour…

  • Créer des Heatmaps à partir de grosses matrices en R

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    par

    Guillaume Devailly
    dans
    Créer des Heatmaps à partir de grosses matrices en R

    En géno­mique, et sans doute dans tout un tas d'autres domaines omiques ou big data, nous essayons sou­vent de tra­cer des grosses matrices sous forme d'heat­map. Par grosse matrice, j'entends une matrice dont le nombre de lignes et/​ou de colonnes est plus grand que le nombre de pixels sur l'écran que vous uti­li­sez. Par exemples,…

  • Trouver un emploi/​une thèse en bioinformatique : quelques pistes [maj]

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    par

    azerin
    dans
    Trouver un emploi/​une thèse en bioinformatique : quelques pistes [maj]

    Comme le disait Estel en 2012, trou­ver un job en bioin­fo n'est pas évident. Contrai­re­ment à cer­tains métiers qui concentrent l'entièreté des offres d'emploi de leur pays en une seule pla­te­forme, les emplois de bioin­fo sont dis­tri­buées aléa­toi­re­ment entre des dizaines de sites d'annonces plus ou moins spé­ci­fiques à la bio­in­for­ma­tique. C'est pour­quoi l'article d'Estel…