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Astuce :
Analyses rapides de fichiers

Analyse de fichiers dans le bon vieux temps ! | Creative Commons 2.0, wikimedia

Langage : shell, sous GNU/Linux
Commandes présentées : wc, awk, sed, tr, head, nl, cut
Niveau : débutant
Dans le cadre de notre travail, nous sommes souvent amenés à manipuler de nombreux fichiers contenant des milliers de lignes et des dizaines de champs. Dans ces cas-là, nous avons souvent tendance à virer à la paranoïa et à vouloir nous assurer que nos fichiers sont bien formatés et contiennent bien le nombre de lignes, champs ou éléments attendus...

Astuce :
Commandline Tips : Extraction du x-ième champ d'un fichier organisé en colonne

But : Dans un fichier organisé en colonne, extraire la (ou les) colonne(s) qui nous intéressent
Prérequis : Savoir utiliser grep est un plus.
Difficulté : 1/5 (Facile)
Nous souhaitons dans le fichier PDB 6CSC  extraire la première et la quatrième colonne des lignes débutant par le mot clef "ATOM"
Préparation des données :
La première chose à faire est d'extraire les lignes contenant avec mot clef "ATOM", pour cela nous allons utiliser grep...