Étiquette : formule

  • Comparaison de structures : le TM-Score

    Comparaison de structures : le TM-Score

    Pour com­pa­rer des struc­tures 3D de pro­téines, nous avons vu le RMSD dans un pré­cé­dent article. Je vous pro­pose cette semaine de par­ler du TM-Score décrit par Zhang et Skol­nick en 2004. Les bases Le TM-Score a été déve­lop­pé afin de cal­cu­ler la qua­li­té des struc­tures de pro­téines pré­dites lors de la com­pé­ti­tion CASP5. Le but…

  • Comparaison de structures : le RMSD

    Comparaison de structures : le RMSD

    En 1973, Anfin­sen mon­trait qu'une pro­téine se replie en une struc­ture unique et stable. Même si des excep­tions existent, cette règle s'applique à la plu­part des petites pro­téines glo­bu­laires. La struc­ture des pro­téines est non seule­ment stable mais aus­si plus conser­vée que la séquence au cours de l'évolution. En effet, des pro­téines ayant des séquences très…