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- Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012 -

Étiquette : Api

  • À la découverte de BioMart !

    —

    par

    Nolwenn
    dans
    À la découverte de BioMart !

    Dans le cadre de mon tra­vail, j'ai récem­ment décou­vert un outil for­mi­dable pour la consul­ta­tion et la récu­pé­ra­tion de don­nées à par­tir de cer­taines banques : Bio­Mart. Après avoir pas­sé la frus­tra­tion de devoir uti­li­ser l'interface du ser­vice four­ni pour télé­char­ger les dif­fé­rentes don­nées dont j'avais besoin, je me suis ren­sei­gnée davan­tage sur ce logi­ciel. De…

  • Débuter avec l'API Ensembl (Perl)

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    par

    tadaima
    dans
    Débuter avec l'API Ensembl (Perl)

    But : Décou­vrir com­ment on peut accé­der très sim­ple­ment aux infor­ma­tions d'Ensembl à l'aide d'un script Perl. Niveau : débu­tant. Pré-requis : Avoir des notions de Perl allant jusqu'à l'utilisation de librai­ries. Avoir accès à une machine où les librai­ries Perl d'Ensembl sont ins­tal­lées. Par­mi les sites agré­geant de l'information bio­lo­gique, Ensem­bl four­nit une API (Appli­ca­tion Pro­gram­ming Inter­face)…