Étiquette : awk
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Analyses rapides de fichiers
Langage : shell, sous GNU/Linux Commandes présentées :wc, awk, sed, tr, head, nl, cut Niveau : débutant Dans le cadre de notre travail, nous sommes souvent amenés à manipuler de nombreux fichiers contenant des milliers de lignes et des dizaines de champs. Dans ces cas-là, nous avons souvent tendance à virer à la paranoïa et à vouloir nous…
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Command line Tips : passage de variable dans awk
But : Dans un fichier organisé en colonnes, nous allons extraire les lignes contenant un mot (donné en argument) dans une colonne fixée à l'avance (1ère colonne). Prérequis : Connaître un peu le shell (pour l'exercice). Difficulté : 2/5 (Facile) Exercice : Pour agrémenter la note, on extraira dans quatre fichiers distincts les lignes contenant les quatre mots les…
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Commandline Tips : Extraction du x-ième champ d'un fichier organisé en colonne
But : Dans un fichier organisé en colonne, extraire la (ou les) colonne(s) qui nous intéressent Prérequis : Savoir utiliser grep est un plus. Difficulté : 1/5 (Facile) Nous souhaitons dans le fichier PDB 6CSC extraire la première et la quatrième colonne des lignes débutant par le mot clef "ATOM" Préparation des données : La première chose à faire…