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- Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012 -

Étiquette : Entrez Gene

  • Chercher des motifs dans un fichier

    —

    par

    Nolwenn
    dans
    Chercher des motifs dans un fichier

    Lan­gage : shellCom­mandes pré­sen­tées : grep, split (suc­cin­te­ment)Niveau : débu­tant Présentation de la commande grep La com­mande grep est dis­po­nible nati­ve­ment sur la plu­part des sys­tèmes d'exploitation GNU/​Linux. La plu­part des uti­li­sa­teurs uti­lisent cette com­mande pour recher­cher un mot ou un groupe de mots, que nous appel­le­rons motif (pat­tern en anglais), dans un fichier texte. Cepen­dant cette com­mande…

  • À la découverte de BioMart !

    —

    par

    Nolwenn
    dans
    À la découverte de BioMart !

    Dans le cadre de mon tra­vail, j'ai récem­ment décou­vert un outil for­mi­dable pour la consul­ta­tion et la récu­pé­ra­tion de don­nées à par­tir de cer­taines banques : Bio­Mart. Après avoir pas­sé la frus­tra­tion de devoir uti­li­ser l'interface du ser­vice four­ni pour télé­char­ger les dif­fé­rentes don­nées dont j'avais besoin, je me suis ren­sei­gnée davan­tage sur ce logi­ciel. De…