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- Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012 -

Étiquette : parallélisation

  • La programmation concurrente en python

    La programmation concurrente en python

    Ce tuto­riel est une tra­duc­tion infi­dèle d'un article de real​py​thon​.com https://​real​py​thon​.com/​p​y​t​h​o​n​-​c​o​n​c​u​r​r​e​n​c​y​/​#​w​h​e​n​-​t​o​-​u​s​e​-​c​o​n​c​u​r​r​e​ncy Mer­ci à eux pour leur for­mi­dable tra­vail et leur auto­ri­sa­tion. Vous avez cer­tai­ne­ment enten­du par­ler de la librai­rie asyn­cio qui a été ajou­té à Python 3 et vous êtes curieux de savoir com­ment elle se place par rap­port aux autres méthodes de pro­gram­ma­tions concur­rentes ?…

  • Snakemake aller plus loin avec la parallélisation

    Snakemake aller plus loin avec la parallélisation

    Bon­jour à tous, bien­ve­nue dans un nou­vel épi­sode de tuto­riels sur Sna­ke­make (épi­sode pré­cé­dent). Aujourd'hui nous allons voir ensemble com­ment paral­lé­li­ser faci­le­ment par la don­née grâce à Sna­ke­make. L'idée géné­rale consiste à décou­per les fichiers bruts au début de notre pipe­line et de les ras­sem­bler après les étapes lourdes en cal­cul. Nous allons éga­le­ment voir com­ment…