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- Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012 -

Étiquette : parallélisation

  • La programmation concurrente en python

    La programmation concurrente en python

    Ce tutoriel est une traduction infidèle d'un article de realpython​.com https://​realpython​.com/​p​y​t​h​o​n​-​c​o​n​c​u​r​r​e​n​c​y​/​#​w​h​e​n​-​t​o​-​u​s​e​-​c​o​n​c​u​r​r​e​ncy Merci à eux pour leur formidable travail et leur autorisation. Vous avez certainement entendu parler de la librairie asyncio qui a été ajouté à Python 3 et vous êtes curieux de savoir comment elle se place par rapport aux autres méthodes de programmations concurrentes ?…

  • Snakemake aller plus loin avec la parallélisation

    Snakemake aller plus loin avec la parallélisation

    Bonjour à tous, bienvenue dans un nouvel épisode de tutoriels sur Snakemake (épisode précédent). Aujourd'hui nous allons voir ensemble comment paralléliser facilement par la donnée grâce à Snakemake. L'idée générale consiste à découper les fichiers bruts au début de notre pipeline et de les rassembler après les étapes lourdes en calcul. Nous allons également voir comment…