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- Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012 -

Fabrice Jossinet

J'ai débu­té mon par­cours de cher­cheur par un doc­to­rat en bio­lo­gie molé­cu­laire et cel­lu­laire à l'Université de Stras­bourg. Mon sujet por­tait sur l'étude struc­tu­rale de l'ARN géno­mique du VIH au moyen d'approches "mouillées". Au cours de ce doc­to­rat, je me suis pas­sion­né pour l'approche bio­in­for­ma­tique. A la suite d'un DESS de double-com­pé­tence en infor­ma­tique, j'ai été recru­té en tant que Maître de Confé­rences en 2002 dans cette même Uni­ver­si­té. Spé­cia­li­sé dans l'étude des rela­tions struc­ture-fonc­tion des ARN non-codants, j'ai déve­lop­pé l'outil Assemble2 (http://​www​.bio​in​for​ma​tics​.org/​a​s​s​e​m​b​l​e​/​i​n​d​e​x​.​h​tml). Cet outil a per­mis la construc­tion et l'étude de plu­sieurs archi­tec­tures d'ARN dont les pre­miers ribo­somes euca­ryo­tiques (levure, germe de blé, Try­pa­no­some,…).


Mon acti­vi­té se divise aujourd'hui entre le sup­port bio­in­for­ma­tique pour des pro­jets col­la­bo­ra­tifs et la res­pon­sa­bi­li­té d'une équipe. Au sein de cette équipe, nous déve­lop­pons des outils expé­ri­men­taux et bio­in­for­ma­tiques pour com­prendre le pro­ces­sus d'infection de la levure patho­gène Can­di­da gla­bra­ta. Nos approches com­prennent notam­ment l'ingénierie de génome par CRIS­PR-Cas9, le dual RNA-Seq hôte-patho­gène, l'annotation de génomes et la recons­truc­tion de réseaux bio­lo­giques.


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