Fabrice Jossinet

J'ai débuté mon parcours de chercheur par un doctorat en biologie moléculaire et cellulaire à l'Université de Strasbourg. Mon sujet portait sur l'étude structurale de l'ARN génomique du VIH au moyen d'approches "mouillées". Au cours de ce doctorat, je me suis passionné pour l'approche bioinformatique. A la suite d'un DESS de double-​compétence en informatique, j'ai été recruté en tant que Maître de Conférences en 2002 dans cette même Université. Spécialisé dans l'étude des relations structure-​fonction des ARN non-​codants, j'ai développé l'outil Assemble2 (http://​www​.bioinformatics​.org/​a​s​s​e​m​b​l​e​/​i​n​d​e​x​.​h​tml). Cet outil a permis la construction et l'étude de plusieurs architectures d'ARN dont les premiers ribosomes eucaryotiques (levure, germe de blé, Trypanosome,…).

Mon activité se divise aujourd'hui entre le support bioinformatique pour des projets collaboratifs et la responsabilité d'une équipe. Au sein de cette équipe, nous développons des outils expérimentaux et bioinformatiques pour comprendre le processus d'infection de la levure pathogène Candida glabrata. Nos approches comprennent notamment l'ingénierie de génome par CRISPR-​Cas9, le dual RNA-​Seq hôte-​pathogène, l'annotation de génomes et la reconstruction de réseaux biologiques.