bed & fasta
Après la petite histoire de l’analyse des séquences d’ADN, voici un tutoriel pour apprendre quelques trucs et astuces dans ce domaine.
Biologiste en mal de connaissances de programmation ou pro de R, vous trouverez ici de quoi vous amuser avec un fichier Fasta ou un Bed.
Nous allons voir comment faire un alignement multiple de séquences (voir ici pour un état de l'art des logiciels existants), produire un logo, analyser les motifs enrichis dans des pics de CHiP, et plus encore...
L'ADN renferme le secret de la vie| Public Domain CC0
L'analyse de séquences est une mission centrale de la bioinformatique. Quelques mots sur celle de l'ADN, un domaine incontournable dans lequel les chercheurs s’attèlent à comprendre la fonction des régions régulatrices du génome et des gènes grâce aux nouvelles technologies.
Le credo de la bio
Nombre de publications par année à propos de l'analyse de séquences ADN dans Pubmed
En biologie, il existe de nombreuses macromolécules renfermant un code permettant d’exécuter des processus cellulaires et moléculaires...
Photo de groupe JOBIM2013 | ©GenoToul/MarionGalindo
Ça y est, les JOBIM 2013 ont eu lieu. Cela se passait à Toulouse au Centre des Congrès Pierre Baudis. Ce fut une semaine bien chargée et bioinformatiquement très intéressante. Les sessions plénières ainsi que les parallèles ont rencontré un certain succès. Cette année les conférenciers invités étaient au nombre de six : Simon Anders (EMBL, Heildelberg), Christine Brun (TAGC, Marseille), Laurent Duret (LBBE, Lyon), Jean-Loup Faulon (Université d'Evry), Roderic Guigo (CRG, Barcelone) et Pedro Mendes (Université de Manchester)...
