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- Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012 -

Étiquette : gestionnaire de version

  • Packrat ou comment gérer ses packages R par projet

    Packrat ou comment gérer ses packages R par projet

    Je vais m'arrêter là, je pense que vous avez com­pris que la ges­tion de packages sous R est une source d'erreurs faciles. Mais pas d'inquiétude : Packrat fait tout ça , Packrat est simple, Packrat vous veut du bien ! Packrat ? Kézako ? Packrat c'est un petit package R. "Encore un ?!" vous allez me dire, oui mais il…

  • Git : cloner un projet, travailler à plusieurs et créer des branches

    Git : cloner un projet, travailler à plusieurs et créer des branches

     Git est un logi­ciel de contrôle de ver­sions de fichiers. Il est dis­tri­bué sous licence GNU GPLv2 et est dis­po­nible sur les prin­ci­paux sys­tèmes d'exploitation. Dans l'article pré­cé­dent, nous avions vu com­ment ins­tal­ler et confi­gu­rer git, com­ment créer un dépôt pour un pro­jet, ain­si que les prin­cipes de base de ges­tion de ver­sions. Dans cet article,…

  • The Bio Code : guide du bon broinformaticien

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    The Bio Code : guide du bon broinformaticien

    Mal­gré la mul­ti­tude d’outils déjà exis­tants, les occa­sions d'écrire du code sont nom­breuses en bio­in­for­ma­tique. Hor­mis pour les pousse-bou­tons aver­tis, le déve­lop­pe­ment fait sou­vent par­tie du quo­ti­dien d’un bio­in­for­ma­ti­cien. Per­son­nel­le­ment, c’est une acti­vi­té qui me plaît beau­coup dans ce métier. Déve­lop­per ses propres appli­ca­tions et outils apporte tou­jours une cer­taine satis­fac­tion (et quand ça fonc­tionne,…

  • Comment organiser son travail ?

    Comment organiser son travail ?

    L'organisation du tra­vail peut sem­bler facile, ce n'est pas tou­jours le cas, sur­tout lorsque l'on est impli­qué dans 2 ou 3 pro­jets à la fois. Com­ment se sou­ve­nir de ce que l'on a fait il y a un mois alors même que l'on ne sait plus ce que l'on a fait la veille ? Où sont…