Étiquette : gestionnaire de version
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Packrat ou comment gérer ses packages R par projet
Qui ne s'est jamais retrouvé coincé entre deux projets R utilisant deux versions différentes d'un même package ? Qui n'a jamais eu cette idée folle, un jour d'inventer un cas d'école (via R) qu'il souhaitait partager ? Qui n'a jamais eu à chercher quelle version de package est nécessaire avec un code récupéré d'un collègue pour qu'il fonctionne comme celui…
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Git : cloner un projet, travailler à plusieurs et créer des branches
Git est un logiciel de contrôle de versions de fichiers. Il est distribué sous licence GNU GPLv2 et est disponible sur les principaux systèmes d'exploitation. Dans l'article précédent, nous avions vu comment installer et configurer git, comment créer un dépôt pour un projet, ainsi que les principes de base de gestion de versions. Dans cet article,…
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The Bio Code : guide du bon broinformaticien
Malgré la multitude d’outils déjà existants, les occasions d'écrire du code sont nombreuses en bioinformatique. Hormis pour les pousse-boutons avertis, le développement fait souvent partie du quotidien d’un bioinformaticien. Personnellement, c’est une activité qui me plaît beaucoup dans ce métier. Développer ses propres applications et outils apporte toujours une certaine satisfaction (et quand ça fonctionne,…
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Comment organiser son travail ?
L'organisation du travail peut sembler facile, ce n'est pas toujours le cas, surtout lorsque l'on est impliqué dans 2 ou 3 projets à la fois. Comment se souvenir de ce que l'on a fait il y a un mois alors même que l'on ne sait plus ce que l'on a fait la veille ? Où sont…