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- Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012 -

Catégorie : Opinion

  • Les pièges mentaux à éviter pour les plus jeunes chercheurs

    Les pièges mentaux à éviter pour les plus jeunes chercheurs

    Aujourd'hui, j'aimerais expri­mer une opi­nion que je ne vois pas et qui fait suite à quelques conseils don­nées aux doc­to­rants dans ce blog. Ce mes­sage s'adresse à tous, dans une com­mu­nau­té à laquelle je n'appartiens plus vrai­ment n'étant plus dans l'académique. Nous évo­que­rons ici cer­tains cli­chés que j'ai enten­du. Un jour on est jeune, on…

  • Les IA génératives ne sont pas vos amies !

    Les IA génératives ne sont pas vos amies !

    Cher jour­nal, je t'écris pour répondre à un billet que tu as publié plus tôt. Pour le résu­mer avec un peu de mau­vaise foi : uti­li­ser des IA géné­ra­tives, c'est trop cool. Contexte ? Je ne vais ici par­ler que d'IA géné­ra­tive, pas d'autres méthodes d'IA comme celles qui per­mettent de faire de la clas­si­fi­ca­tion ou du…

  • Ne devenez pas un dinosaures : adoptez un copilot !

    Ne devenez pas un dinosaures : adoptez un copilot !

    Sauf si vous vivez dans une grotte, sur une pla­nète sans ordi­na­teur ni télé­vi­sion, le terme ChatGPT doit main­te­nant réson­ner à vos oreilles comme le der­nier jouet à la mode. Après avoir fait des ravages consi­dé­rables dans le domaine du trai­te­ment du lan­gage, de l'imagerie et de nom­breux autres domaines, le Deep Lear­ning est en…

  • Caricature de la bioinformatique pour mon collègue IT

    Caricature de la bioinformatique pour mon collègue IT

    Ce blog n'est pas tou­jours lisible pour ma mère. Ce blog n'est pas lisible pour mes grands-parents, mais sur­tout, il ne l'est pas pour toi, mon col­lègue infor­ma­ti­cien. Toi qui ne me com­prends pas quand je te dis que je tra­vaille sur des don­nées de grande dimen­sion et qui ima­gines des images ou du texte.…

  • Pourquoi je ne lis pas tous les CVs de la même manière

    Pourquoi je ne lis pas tous les CVs de la même manière

    Dans un pré­cé­dent billet je me suis lais­sé vaga­bon­der autour de l'idée qu'un bio­in­for­ma­ti­cien était un data truc comme un autre. Dans ces lignes je vais expri­mer pour­quoi il est impor­tant à mon sens de bien tra­vailler son CV… et ce qui per­son­nel­le­ment me fait réflé­chir sur la forme de CV liée à nos métiers.…

  • De bioinformaticien à data scientist, un simple pas ?

    De bioinformaticien à data scientist, un simple pas ?

    Nom­breux par­mi nous se retrouvent un jour en fin de master/​thèse ou post­doc de bio­in­for­ma­tique. A ce moment là, dans les dif­fi­cul­tés de la recherche d'emplois on vient à se deman­der : "Et si je pos­tu­lais à toutes ces offres de data scien­tist ?"Dans ces lignes, je vais don­ner mon avis de manière libre, sur pour­quoi…

  • Qu'est-ce qu'un bon fichier Lisez-moi.txt

    Qu'est-ce qu'un bon fichier Lisez-moi.txt

    Vous venez de finir votre outil sur lequel vous tra­vaillez depuis 1 semaine/​1 mois/​1 an/​10 ans (rayez la men­tion inutile) qui va révo­lu­tion­ner votre domaine. Votre code est ver­sion­né, for­ma­té, com­men­té, docu­men­té, tes­té, les résul­tats sont éva­lués selon le gold stan­dard de la dis­ci­pline sur des jeux de don­nées repré­sen­ta­tifs de la réa­li­té, votre publi­ca­tion…

  • Choisir entre R et Python en bioinformatique ? Regards croisés entre collègues enseignants-chercheurs

    Choisir entre R et Python en bioinformatique ? Regards croisés entre collègues enseignants-chercheurs

    Gaëlle Lelan­dais et Pierre Pou­lain Qui sommes-nous ? Tous les deux pas­sion­nés par l’enseignement, les pro­blé­ma­tiques de big data et d’analyse de don­nées en bio­lo­gie, nous nous côtoyons pro­fes­sion­nel­le­ment depuis 15 ans, avec écoute et bien­veillance. Si l’étiquette de « bio­in­for­ma­ti­cien » nous est sou­vent attri­buée, nous sommes pour­tant très dif­fé­rents. Je (Gaëlle) tra­vaille sur des pro­blé­ma­tiques de…