Catégorie : Opinion

  • Pourquoi je ne lis pas tous les CVs de la même manière

    Pourquoi je ne lis pas tous les CVs de la même manière

    Dans un pré­cé­dent billet je me suis lais­sé vaga­bon­der autour de l'idée qu'un bio­in­for­ma­ti­cien était un data truc comme un autre. Dans ces lignes je vais expri­mer pour­quoi il est impor­tant à mon sens de bien tra­vailler son CV… et ce qui per­son­nel­le­ment me fait réflé­chir sur la forme de CV liée à nos métiers.…

  • De bioinformaticien à data scientist, un simple pas ?

    De bioinformaticien à data scientist, un simple pas ?

    Nom­breux par­mi nous se retrouvent un jour en fin de master/​thèse ou post­doc de bio­in­for­ma­tique. A ce moment là, dans les dif­fi­cul­tés de la recherche d'emplois on vient à se deman­der : "Et si je pos­tu­lais à toutes ces offres de data scien­tist ?"Dans ces lignes, je vais don­ner mon avis de manière libre, sur pour­quoi…

  • Qu'est-ce qu'un bon fichier Lisez-moi.txt

    Qu'est-ce qu'un bon fichier Lisez-moi.txt

    Vous venez de finir votre outil sur lequel vous tra­vaillez depuis 1 semaine/​1 mois/​1 an/​10 ans (rayez la men­tion inutile) qui va révo­lu­tion­ner votre domaine. Votre code est ver­sion­né, for­ma­té, com­men­té, docu­men­té, tes­té, les résul­tats sont éva­lués selon le gold stan­dard de la dis­ci­pline sur des jeux de don­nées repré­sen­ta­tifs de la réa­li­té, votre publi­ca­tion…

  • Choisir entre R et Python en bioinformatique ? Regards croisés entre collègues enseignants-chercheurs

    Choisir entre R et Python en bioinformatique ? Regards croisés entre collègues enseignants-chercheurs

    Gaëlle Lelan­dais et Pierre Pou­lain Qui sommes-nous ? Tous les deux pas­sion­nés par l’enseignement, les pro­blé­ma­tiques de big data et d’analyse de don­nées en bio­lo­gie, nous nous côtoyons pro­fes­sion­nel­le­ment depuis 15 ans, avec écoute et bien­veillance. Si l’étiquette de « bio­in­for­ma­ti­cien » nous est sou­vent attri­buée, nous sommes pour­tant très dif­fé­rents. Je (Gaëlle) tra­vaille sur des pro­blé­ma­tiques de…

  • Pourquoi écrire sur un blog communautaire ?

    Pourquoi écrire sur un blog communautaire ?

    7 ans… 7 ans entre l'écriture de mon pre­mier article ici et aujourd'hui. De cette longue route m'est venue l'envie de faire un billet per­son­nel sur pour­quoi à mon sens, un blog com­mu­nau­taire a plus d'importance qu'un blog per­son­nel. Les réflexions qui suivent sont tota­le­ment per­son­nelles et n'engagent que moi. * Mon histoire sur ce…

  • Doctorant dis toi que…

    Doctorant dis toi que…

    Je vous pro­pose aujourd'hui un petit article résu­mant les tra­vers typiques pen­dant une thèse. Ces pro­pos sont pure­ment issus de mon expé­rience récente de thèse (finie en 2019) de thèse ain­si que d'autres doctorants/​docteurs dans mon entou­rage. Toute la suite de l'article ne reflète que mon opi­nion per­son­nelle de ce grand moment de la vie…

  • Le déclin (relatif) de la production bioinformatique française

    Le déclin (relatif) de la production bioinformatique française

    L’idée de cet article vient d’une étude réa­li­sée en 2008 par Jean Lobry, Pro­fes­seur à l’Université Claude Ber­nard – Lyon 1, ceci dans le cadre de ses ensei­gne­ments en bio­in­for­ma­tique (plus exac­te­ment ses TD sur le lan­gage R). Mon objec­tif était de regar­der la dyna­mique de publi­ca­tion de la France dans le domaine de la…

  • L'intérêt d'une communauté scientifique bioinformatique

    L'intérêt d'une communauté scientifique bioinformatique

    "Tout seul on va plus vite, ensemble, on va plus loin". Pro­verbe afri­cain Il est un constat que je fais de plus en plus sou­vent et qui m'attriste à chaque fois un peu plus : notre belle socié­té semble tendre vers l'individualisme. Il est pro­bable que l'émergence des réseaux sociaux et à l'actuel culte du nom­bri­lisme…

  • Pourquoi vous avez besoin d'un blog scientifique !

    Pourquoi vous avez besoin d'un blog scientifique !

    Mon titre étant volon­tai­re­ment pro­vo­ca­teur je vais com­men­cer par le modé­rer et l'expliquer. Vous n'avez pas for­cé­ment besoin de votre blog, vous avez besoin d'un espace ou vous pou­vez écrire des textes struc­tu­rés avec des tableaux, des images et la pos­si­bi­li­té de les rendre publics faci­le­ment. Un dépôt Github comme un compte Twit­ter peuvent ain­si…