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- Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012 -

Étiquette : transcription

  • Qu'est-ce qu'un site d'initiation de la transcription ?

    —

    par

    Guillaume Devailly
    dans
    Qu'est-ce qu'un site d'initiation de la transcription ?

    Comment je me suis posé la question. Chez les euca­ryotes, l'ADN est orga­ni­sé en domaines plus ou moins com­pac­tés, avec des taux de trans­crip­tion plus ou moins éle­vés, et qui sont mar­qués dif­fé­ren­tiel­le­ment par un cer­tain nombre de marques épi­gé­né­tiques (méthy­la­tion de l'ADN, modi­fi­ca­tions post-tra­duc­tion­nelles des his­tones, variants d'histones, etc.). Il est fré­quent d'essayer de…

  • DNase-seq, FAIRE-seq, ChIP-seq, trois outils d'analyse de la régulation de l'expression des gènes

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    par

    Isabelle S. (ZaZo0o)
    dans
    DNase-seq, FAIRE-seq, ChIP-seq, trois outils d'analyse de la régulation de l'expression des gènes

    La régu­la­tion de la trans­crip­tion est un pro­ces­sus indis­pen­sable aux cel­lules pour per­mettre leur dif­fé­ren­cia­tion, expri­mer leur spé­ci­fi­ci­té, assu­rer leur déve­lop­pe­ment, leur pro­li­fé­ra­tion ou encore pour leur per­mettre de s'adapter à un envi­ron­ne­ment. L'étude de la régu­la­tion de la trans­crip­tion passe par l'identification d'éléments clés gou­ver­nant ces pro­ces­sus bio­lo­giques.Ces élé­ments de régu­la­tions se dis­tinguent en…

  • Comment détecter, compiler et annoter des facteurs de transcription ?

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    par

    Isabelle S. (ZaZo0o)
    dans
    Comment détecter, compiler et annoter des facteurs de transcription ?

    Après la réunion de ren­trée de tous les contri­bu­teurs du blog, nous avons déci­dé d'étendre la rubrique "Jour­nal Club". Ain­si, il est désor­mais non seule­ment pos­sible mais aus­si for­te­ment recom­man­dé de pro­po­ser des billets dis­cu­tant d'un article en par­ti­cu­lier. Nous inau­gu­rons cette exten­sion avec un sujet pas­sion­nant : la détec­tion de fac­teurs de trans­crip­tion. Bonne lec­ture…