Circos poster
La visualisation de données est un problème récurrent dans un grand nombre de disciplines. En bioinformatique, il est souvent difficile de représenter de manière efficace des quantités massives de données. Une « bonne » représentation graphique doit être adaptée au type de données que l’on souhaite visualiser et surtout aux résultats que l’on souhaite mettre en évidence...
Bonjour, et bienvenu dans mon premier article concernant mon script Perl Blast2Gb.pl. Ce dernier illustre parfaitement ce qu'on peut faire facilement et rapidement avec un script Perl : du traitement de texte. Cet outil permet de faciliter la vie et de transformer une tâche laborieuse en un traitement rapide et efficace.
En effet, qui ne s'est jamais retrouvé avec une sortie de BLAST qu'il voudrait regarder dans un programme de visualisation de séquences (comme Geneious par exemple) mais qui ne prend pas les sorties de BLAST ? Ou encore, devant soumettre un génome au NCBI, mais qui n'a pas envie de se taper tout le formatage à la main ? Eh bien, mon programme est là pour prendre une sortie xml d'un blastn, blastx, tblastn ou tblastx et la transformer en une sortie ...
