Étiquette : EMBL
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Bioconvert - simplifier les conversions de formats
Bioconvert Qui n'a jamais eu à convertir un fichier de données biologiques dans un autre format ? Il y a bien sur le classique fastq vers fasta, pour lequel nombre d'entre nous ont codé un convertisseur "maison", pas forcément optimal. D'autres formats sont parfois plus problématiques, par exemple la conversion vers et depuis GFF2/GFF3. De ces différents…
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Les bases de données de séquençage : GEO, SRA, ENA, ArrayExpress
De nos jours, lors de la publication de résultats, il est nécessaire de rendre public les éventuelles données de séquençage générées. Si un faible nombre d’irréductibles continuent à ne fournir les données que sur demande, les bonnes pratiques poussent à les déposer dans des bases de données librement accessibles. Quatre grandes bases de données de séquençage…
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European Molecular Biology Laboratory (EMBL)
Voici un article d'un nouveau genre sur bioinfo-fr : après les lieux pour vous former à la bioinformatique, voici les lieux où postuler pour un stage ou pour travailler une fois votre diplôme en poche. Et aujourd'hui je m'attaque à une grosse pièce puisque je vais vous parler de l'EMBL (European Molecular Biology Laboratory ). Un…
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La métagénomique et les défis pour la bioinformatique au goût #IHMC2012
On vous avait dit il y a peu qu'on allait vous parler du Congrès international sur le microbiome humain (International Human Microbiome Congress 2012). Pour quelques raisons, votre humble serviteure a tardé avec son forfait. Mais voici que c'est maintenant chose faite : nous espérons que la frustration sera vite oubliée 😉 Je vous avais déjà…