Formation :
Cartographie des formations en bioinformatique en France

L'origine du projet :
Dans le cadre d'un projet tutoré du master de Bioinformatique de Rennes, nous avons mis en place un pipeline d'analyse des mails envoyés par la SFBI durant l'année 2014. Plusieurs modules ont été développés sous la forme de scripts Python, par un ou plusieurs étudiants. Je me chargeais de développer un module capable de générer des cartes à partir des données extraites des mails par d'autres modules...

Formation :
Le Master de Bordeaux s'internationalise!

Le Master Bioinformatique de Bordeaux propose à présent 3 parcours, dès la rentrée 2016-2017:

Le parcours "Biologie Computationnelle" est centré sur l'acquisition de compétences en développement logiciel et les méthodologies de gestion de données incluant la modélisation, la simulation de processus et l'analyse d'images biologiques.
Le parcours "Du Génome aux Ecosystèmes" est focalisé sur l'utilisation avancée des logiciels de bioinformatique avec une spécialisation possible sur les applications moléculaire ("omics") et/ou environnementale (génétique des populations)...

Découverte :
BIOASTER

Le tour des laboratoires proposant d'exercer notre métier de bioinformaticien continue avec la présentation du tout jeune Institut de Technologie en Microbiologie BIOASTER.

Histoire et géographie
BIOASTER ne s'est pas fondé en un jour et ne s'est surtout pas fondé tout seul. Parmi le collège de fondateurs qui a permis à cet institut de voir le jour fin 2012, on dénombre des laboratoires publics (INSERM, CEA, CNRS), l’Institut Pasteur (fondation privée) mais aussi des partenaires privés (Danone, Institut Mérieux, Sanofi-Pasteur)...

Formation :
Présentation de la licence BISM (ex-MIV) à Lyon 1

[Article publié le 12 mars 2014 et mis à jour le 2 décembre 2015]
Présentation
La licence BISM (Bio-Informatique, Statistique et Modélisation), anciennement appelée MIV, est un parcours de spécialisation de la licence de Biologie, à l'université Claude Bernard Lyon 1. L’accent de la formation est mis à la fois sur la bioinformatique et sur l'analyse des données au sens large (modélisation et statistiques)...

Formation :
Présentation du Master Bioinformatique & Génomique de Rennes

Présentation
Le Master Bioinformatique & Génomique (BIG) de l'Université de Rennes 1 a pris en 2013 la suite du Master Modélisation de Systèmes Biologiques (MSB). L’objectif principal de ce Master est de former des étudiants issus d’un cursus biologique, informatique ou mathématique aux besoins pluridisciplinaires en bio-informatique et en technologies à haut-débit de génomique fonctionnelle et post-génomique...

Découverte :
École Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL)

Il y a quelque temps, Akira vous présentait l'EMBL en Allemagne. Place maintenant à la Suisse et à sa mythique EPFL, lieu où vous pourrez espérer décrocher un stage ou même poser vos bagages pour un contrat un peu plus long.

Histoire et géographie
Pour commencer, L'EPFL ne se situe pas tout à fait comme son nom l'indique à Lausanne même (Suisse), mais plutôt à sa périphérie. Elle bénéficie d'un magnifique cadre environnemental puisqu'on retrouve, à quelques centaines de mètres de certains de ses bâtiments, le célèbre lac Léman et qu'on peut également y admirer les Alpes au-delà de celui-ci (juste derrière la berge d'Évian, Thonon ou encore Yvoire (France))...

Découverte :
SIB (Swiss Institute of Bioinformatics)

Suite à l'article sur l'EMBL, voici la présentation d'un autre grand employeur dans le domaine de la bioinformatique. Cette fois-ci c'est un peu plus compliqué, contrairement à l'EMBL qui a ses propres bâtiments et finalement un nombre de lieux de travail réduit, le SIB, dont on va parler aujourd'hui, est réparti sur tout le territoire suisse. Je ne vais donc pas parler de tous les laboratoires et de leurs thèmes de recherche (je vous dirai où trouver ces informations), mais je vais présenter de façon générale ce qu'est le SIB...

Découverte :
RSG Suisse

Création du groupe régional Suisse des étudiants (SC-RSG Switzerland) appartenant à la société internationale de biologie computationnelle (ISCB)
Bonjour à tous,
Par la présente,  je vous annonce la création du groupe régional Suisse du conseil des étudiants appartenant à la société internationale de biologie computationnelle.
La Bioinformatique est largement implantée en Suisse grâce à l’institut Suisse de Bioinformatique (SIB), ses nombreux laboratoires affiliés ainsi que ses infrastructures avec notamment Vital-it, Swiss-prot et CALIPHO, entre autres...

Découverte :
European Molecular Biology Laboratory (EMBL)

Voici un article d'un nouveau genre sur bioinfo-fr : après les lieux pour vous former à la bioinformatique, voici les lieux où postuler pour un stage ou pour travailler une fois votre diplôme en poche. Et aujourd'hui je m'attaque à une grosse pièce puisque je vais vous parler de l'EMBL (European Molecular Biology Laboratory ).
Un peu d'histoire-géo
Créé en 1974 par une organisation intergouvernementale composée de 10 pays (Allemagne, Autriche, Danemark, France, Israël, Italie, Pays-Bas, Royaume-Unis, Suède et Suisse), l'EMBL comprend aujourd'hui 20 états membres (pour la liste complète: EMBL sur wikipédia)...

Astuce :
Trouver un emploi/une thèse en bioinformatique : quelques pistes

Parmi les lecteurs de Bioinfo-fr, il y a très probablement des étudiants de M2 qui, absorbés par leur stage de fin d'année, n'ont pas encore vraiment réfléchi à ce qu'ils voudraient faire à la rentrée ; des thésards dont la soutenance approche et qui aimeraient faire un post-doc à l'étranger ; ou encore des ingénieurs dont le CDD touche à sa fin et qui sont à la recherche d'un autre emploi...