Étiquette : gff3

  • Bioconvert — simplifier les conversions de formats

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    par

    Nico M.
    dans

    Bioconvert Qui n'a jamais eu à conver­tir un fichier de don­nées bio­lo­giques dans un autre for­mat ? Il y a bien sur le clas­sique fastq vers fas­ta, pour lequel nombre d'entre nous ont codé un conver­tis­seur "mai­son", pas for­cé­ment opti­mal. D'autres for­mats sont par­fois plus pro­blé­ma­tiques, par exemple la conver­sion vers et depuis GFF2/​GFF3. De ces dif­fé­rents…

  • Dessiner vos gènes à partir d'un GFF3

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    par

    sacha schutz
    dans ,

    Je découvre à l'instant geno­me­tools, un outil mul­ti­fonc­tion qui est capable de géné­rer une image repré­sen­tant des anno­ta­tions sur un génome de réfé­rence. Idéal par exemple, si vous vou­lez vous pas­ser d'un genome brow­ser comme UCSC ou Ensem­bl pour incrus­ter des images dans votre rap­port. Installation Vous pou­vez récu­pé­rer et com­pi­ler le code source depuis le site offi­ciel. Pour…