Catégorie : Brèves

  • Bioinformaticien•ne : un métier toujours d’avenir

    Bioinformaticien•ne : un métier toujours d’avenir

    Qui d’entre nous ne s’est pas un jour trou­vé en situa­tion d’expliquer son métier de bioinformaticien·ne à ses (grand-)parents/cousins/boulangers/copains d’enfance, etc. ? La Socié­té Fran­çaise de Bio­In­for­ma­tique (SFBI) a ini­tié en 2016 un groupe de tra­vail sur les Métiers de la Bio­in­for­ma­tique (Met­Bif). L'objectif prin­ci­pal est de mieux carac­té­ri­ser nos métiers et de les faire…

  • Dessiner vos gènes à partir d'un GFF3

    Je découvre à l'instant geno­me­tools, un outil mul­ti­fonc­tion qui est capable de géné­rer une image repré­sen­tant des anno­ta­tions sur un génome de réfé­rence. Idéal par exemple, si vous vou­lez vous pas­ser d'un genome brow­ser comme UCSC ou Ensem­bl pour incrus­ter des images dans votre rap­port. Installation Vous pou­vez récu­pé­rer et com­pi­ler le code source depuis le site offi­ciel. Pour…

  • AMBB : Colloque « Les futurs de la bio-informatique »

    AMBB : Colloque « Les futurs de la bio-informatique »

    L’Asso­cia­tion du Master Bio-infor­ma­tique de Bordeaux (AMBB) orga­nise son pre­mier col­loque sur la thé­ma­tique : « Les futurs de la bio-infor­ma­tique ». Il aura lieu Jeu­di 08 Décembre 2016 de 13H à 17H30 dans l’amphi­théâtre B du bâti­ment A29 sur le cam­pus de Talence de l’Université de Bor­deaux (351 Cours de la Libé­ra­tion, 33800 Talence). Cette demi-jour­née a…

  • 4 ans ! Ou 1 an, selon les points de vue

    4 ans ! Ou 1 an, selon les points de vue

    Hap­py bir­th­day to nous ! Le 29 février 2012 nais­sait bioin​fo​-fr​.net sur un coup de tête, après un déjeu­ner ani­mé entre anciens bor­de­lais au Rolex Lear­ning Cen­ter de l'EPFL (ça c'est pour le détail bling-bling de l'histoire). C'est ensuite sur IRC que tout s’accéléra et se mit en place (ça c'est pour le coté Gee­kus). Cela…

  • 3D XPoint : une nouvelle technologie de stockage

    3D XPoint : une nouvelle technologie de stockage

    Vous n'avez pas encore équi­pé votre ordi­na­teur de SSD ? Et bien vous pou­vez aban­don­ner le pro­jet… En effet Intel, en par­te­na­riat avec Micron, a pré­sen­té le 28 juillet une nou­velle tech­no­lo­gie de sto­ckage 3D XPoint (pro­non­cez trois dés ixe point three di cross point). 3D XPoint est bien plus rapide que le sto­ckage flash équi­pant les SSD, mais…

  • La bière décodée dans un Hackuarium

    La bière décodée dans un Hackuarium

    Vous aimez la bière et la science ? Vous vou­lez connaître la com­po­si­tion de votre mousse favo­rite ? Vous avez envie de goû­ter de nou­velles bières proches de celles que vous connais­sez, ou com­plè­te­ment dif­fé­rentes ? Il y a quelques temps déjà, je vous ai décrit la place de la bio­in­for­ma­tique dans les labo­ra­toires citoyens. Aujourd'hui, un pro­jet sym­pa­thique…

  • Former et se former en bioinformatique avec GOBLET !

    Former et se former en bioinformatique avec GOBLET !

    Dans cet article, je vous pré­sen­te­rai un nou­veau site qui peut être inté­res­sant aus­si bien pour les étu­diants que pour les ensei­gnants, voire éga­le­ment pour les bio­in­for­ma­ti­ciens déjà en fonc­tion. Ici je ne vous noie­rai pas sous les lignes de code, mais je vous décri­rai ce que le por­tail GOBLET vous pro­pose en terme d'exercice.…

  • Portrait ADN bioinformatique

    Portrait ADN bioinformatique

    Ce post est le pre­mier d'une nou­velle caté­go­rie du blog vous pro­po­sant des articles plus courts et plus légers sur la bio­in­for­ma­tique. Je com­mence en dou­ceur en vous encou­ra­geant à regar­der les tra­vaux d'une artiste : Hea­ther Dewey-Hag­borg. Les ques­tions posées par son tra­vail et ses recherches sont inté­res­santes, et à mon avis ne sont plus…