Étiquette : méthode

  • Formaliser ses protocoles avec Snakemake

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    par

    Nisaea
    dans , ,
    Formaliser ses protocoles avec Snakemake

    Vous avez dit protocole ? Qui dit bio­lo­gie et bio­in­for­ma­tique dit pro­to­cole expé­ri­men­tal. C'est le cœur de la démarche scien­ti­fique, et un for­ma­lisme adap­té est la clef pour assu­rer la repro­duc­ti­bi­li­té des expé­riences, et ain­si garan­tir la vali­da­tion des décou­vertes par la com­mu­nau­té. En paillasse, les solu­tions pour for­ma­li­ser et conser­ver les pro­to­coles sont plu­tôt natu­rel­le­ment…

  • Métagénomique et Graphique de Recrutement : chercher l'aiguille dans la botte de foin !

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    par

    NiGoPol
    dans
    Métagénomique et Graphique de Recrutement : chercher l'aiguille dans la botte de foin !

    Un inté­rêt cer­tain se déve­loppe pour la com­pré­hen­sion d'écosystèmes com­plexes comme les eaux, les sols ou encore les micro­biomes (plus de 90% des cel­lules du corps humain sont en fait les bac­té­ries qui peuplent son tube diges­tif). Plu­sieurs dif­fi­cul­tés se posent : la plu­part des orga­nismes pré­sents ne sont pas faci­le­ment culti­vables et donc indi­vi­dua­li­sables. tous…