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- Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012 -

Étiquette : séquençage

  • L'analyse de données RNA-seq : mode d'emploi

    L'analyse de données RNA-seq : mode d'emploi

    Un jour, un bio­lo­giste se pointe chez vous avec d'une part un disque dur externe dans la main, d'autre part l'air sou­cieux. Il veut que vous ana­ly­siez ses don­nées RNA-seq. Le disque, c'est parce qu'il a envi­ron 50Gb de don­nées à vous trans­mettre ; l'air sou­cieux, c'est parce qu'elles ont coû­té dans les 15'000 euros, et…

  • Le séquençage, une histoire de générations

    Le séquençage, une histoire de générations

    L'ADN (Acide Désoxy­ri­bo­Nu­cléique) est une molé­cule pré­sente dans toutes les cel­lules des êtres vivants. Elle ren­ferme l'information néces­saire pour se déve­lop­per et se repro­duire. L'information en elle-même est codée par la suite de quatre dif­fé­rents acides nucléiques ordon­nés d'une façon com­pré­hen­sible pour l'organisme. Décryp­ter cette infor­ma­tion est un enjeu majeur pour la recherche scien­ti­fique. Il…

  • Analyse des données de séquençage à ARN

    Analyse des données de séquençage à ARN

    Depuis quelques années, le domaine du séquen­çage de l'information géné­tique est ren­tré dans une nou­velle ère : “le séquen­çage de seconde géné­ra­tion”. Cette avan­cée tech­no­lo­gique a per­mis une ana­lyse plus en pro­fon­deur de l'ADN et l'ARN. Nous pou­vons citer par­mi ces nou­velles tech­no­lo­gies le ChIP-seq (Chro­ma­tine Immu­no Pre­ci­pi­ta­tion sequen­cing) ou RNA-seq (Séquen­çage à ARN). Le pro­jet…

  • Revue de presse : Le printemps, les oiseaux et … la biblio

    Revue de presse : Le printemps, les oiseaux et … la biblio

    Je dois l'avouer : ce mois est un cau­che­mar. Il y avait une tonne de choses pas­sion­nantes ! Alors, le choix d'en lais­ser cer­tains en dehors m'a cau­sé des nuits blanches… Je plai­sante. J'en ai choi­si donc quelques-unes espé­rant que le mélange gour­mand et cro­quant fasse de l'ombre aux émis­sions culi­naires de M6 (clin d'oeil aux Gui­gnols).…