Auteur/autrice : nahoy

Ses publications :

  • Résultat du concours IFB

    Le tirage au sort ayant été effec­tué par nos experts, nous sommes heu­reux d'annoncer que la place pour la for­ma­tion de l'Institut Fran­çais de Bio­in­for­ma­tique, à savoir : IBI‑1 — Uti­li­sa­tion de base du cloud IFB a été rem­por­tée par Julien Fumey ! Nous lui enver­rons donc plus de pré­ci­sions en pri­vé dans la jour­née.   Bra­vo à lui et…

  • Open Refine

    Open Refine

     Un grand coup de balai Le net­toyage de don­nées est un défi en bio­in­for­ma­tique. Entre les per­sonnes qui veulent réin­ven­ter les stan­dards et les per­sonnes qui ne savent pas les suivre, nous nous trou­vons sou­vent en train de net­toyer, de for­ma­ter et de chan­ger la struc­ture de nos don­nées pour qu'elles soient conformes à une…

  • Python fait la numba

    Python fait la numba

    Suite à cet article, j'ai eu envie de com­pa­rer les temps d'exécution de Cython et Num­ba. Il est tou­jours inté­res­sant de faire des tests de per­for­mances (bench­marks) de temps à autre, pour voir si on ne peut pas amé­lio­rer cer­tains de nos algo­rithmes 🙂 Cython est un très bon moyen pour opti­mi­ser vos pro­grammes, mais…

  • Portrait ADN bioinformatique

    Portrait ADN bioinformatique

    Ce post est le pre­mier d'une nou­velle caté­go­rie du blog vous pro­po­sant des articles plus courts et plus légers sur la bio­in­for­ma­tique. Je com­mence en dou­ceur en vous encou­ra­geant à regar­der les tra­vaux d'une artiste : Hea­ther Dewey-Hag­borg. Les ques­tions posées par son tra­vail et ses recherches sont inté­res­santes, et à mon avis ne sont plus…

  • Les vacances

    Les vacances

    L'été est enfin arri­vé et nous allons prendre des vacances bien méri­tées. Ne vous inquié­tez pas, nous serons de retour en sep­tembre avec de nou­veaux articles tou­jours plus inté­res­sants sur le FBA, l'EMBL ou encore un tuto­riel sur l'analyse de don­nées RNA­seq, mais nous n'en dirons pas plus car ils sont encore en pré­pa­ra­tion. Nous…

  • Jouez avec vos données : utilisez un ORM

    Il y a quelques temps, je vous ai par­lé de base de don­nées, un super moyen pour struc­tu­rer vos don­nées. Vous êtes main­te­nant j'en suis sûr, des pro­fes­sion­nels du SELECT, des JOIN et autres ALTER. C'est bien, très bien même, mais main­te­nant je vais vous apprendre à vous en pas­ser. Et oui, la ligne de…

  • SQLite

    SQLite

    Dans un pré­cé­dent article, nous vous avons par­lé des bases de don­nées, leur impor­tance et leur inté­rêt. Ici je vais vous par­ler de SQLite, une biblio­thèque don­nant accès à un moteur de base de don­nées rela­tion­nelle qui vous per­met­tra de tra­vailler avec du SQL et cela sans avoir besoin de confi­gu­rer ou d'installer quoi que…

  • Les indices.…

    Les indices.…

    Les indices sont là !!! Pré­ci­pi­tez vous ! Vous avez encore des chances de gagner. Clô­ture du concours le ven­dre­di 21 décembre 23h59 (avant la fin du monde). Nous annon­ce­rons les gagnants le lun­di 7 jan­vier.   En vous sou­hai­tant de bonnes fêtes de fin d'année. L'équipe bioin​fo​-fr​.net, en vacances (bien méri­tées) jusqu'au 7 jan­vier 2013.

  • J’ai lu : Quand la vie remplace le silicium

    J’ai lu : Quand la vie remplace le silicium

    Auteurs Den­nis Sha­sha, pro­fes­seur d'informatique au Cou­rant ins­ti­tute, Uni­ver­si­té de New York et Cathy Lazere, écri­vaine spé­cia­li­sée en sciences et tech­no­lo­gies. Sujet Cet ouvrage retrace le pro­fil d’une quin­zaine de scien­ti­fiques et s’intéresse aux pro­blé­ma­tiques et enjeux aux­quels ils font face aux fron­tières de la bio­in­for­ma­tique. Résumé En paral­lèle avec la car­rière de plu­sieurs cher­cheurs,…