J'ai lu :
J'ai lu : Bioinformatique, Cours et cas pratiques

Ce mois-ci, j'ai lu pour vous "Bioinfomatique, Cours et cas pratique," un ouvrage de Gilbert Deléage et Manolo Gouy, paru en 2013 aux éditions Dunod. Il s'agit d'un livre à destination des étudiants en licence et master qui souhaitent découvrir la bioinformatique des protéines du point de vue du biologiste. C'est donc un ouvrage très orienté outils et analyses.

©Dunod

Sujet

De nos jours, un biologiste souhaitant analyser des séquences de protéines nouvellement produites passera forcément par des outils bioinformatiques. Comme tout le monde n'a pas un ingénieur bioinformaticien sous la main, la connaissance des méthodes et outils disponibles devient cruciale pour tout biologiste. Le livre "Bioinformatique, Cours et cas pratique" vous permettra de découvrir ces méthodes et de répondre à de nombreuses questions comme : Est-ce que ma séquence est déjà répertoriée dans une base de données ? Appartient-elle à une famille connue ? Est-ce qu'elle a des homologues dans d'autres organismes ? Peut-on prédire sa structure 3D ? Peut-on prédire sa fonction ? Y a-t-il des résidus ou des motifs essentiels à la fonction ?...

Plus précisément, le livre aborde la recherche dans des bases de données, l'alignement de séquences, la phylogénie moléculaire, la prédiction de fonction et la prédiction de structure. En fin d'ouvrage, un cas pratique est proposé afin d'illustrer les différentes étapes d'analyse d'une séquence de protéine.

Public visé

Les étudiants en IUT, Licence, et Master de biologie ou biochimie sont clairement la cible privilégiée de cet ouvrage. Néanmoins, on y trouve un panorama des méthodes d'analyse des protéines qui pourra intéresser des chercheurs, des ingénieurs, voire des enseignants qui y trouveront des idées pour leurs cours.

Revue

Le livre est clair et bien structuré. On y trouve les bases de l'analyse de séquences protéiques, de la phylogénie moléculaire et de la prédiction de structure des protéines. C'est un ouvrage par lequel les étudiants peuvent commencer, il leur servira longtemps.

Disponibilité

Ce livre est disponible chez Dunod à 21,85 € ou sur Amazon et autres.

Si vous avez ce livre dans votre bibliothèque, n'hésitez pas à partager votre avis.

Je remercie Ook4mi, Bu et Zazo0o pour leur relecture.

• À propos de Guillaume Collet

• Je suis actuellement en post-doc dans l'équipe DYLISS de L'IRISA à Rennes. Je travaille sur la reconstruction automatique de réseaux métaboliques. Plus particulièrement, je m'intéresse aux aspects fouille de connaissance, combinatoire, base de données en graphe. Mais dans un passé pas si lointain, je me suis aussi intéressé aux séquences de protéines, à leur alignement et à la prédiction de leur structures.