Archives par tags: bioinformatique

Editorial :
6 ans... et des questions !

Vous ne le saviez peut-être pas mais nous venons de souffler fièrement notre sixième bougie !
6 ans ! Que de savoir autour de la bioinformatique partagé ! Merci à toutes et à tous pour vos soutiens sans faille.
On voulait marquer le coup cette année : nous avons donc mis en place un questionnaire orienté autour du quotidien d'un(e) bioinformaticien(ne). L'idée est de proposer une photo du paysage bioinfo francophone en 2018...

Editorial :
Et surtout : la bonne année !

Bonne année 2018 à vous tous les Geekus biologicus !
D'une pierre deux coups : nos vœux et la reprise des publications.
N'hésitez pas à venir toquer à la porte si jamais l'envie vous prend de rédiger un ou plusieurs articles !
Merci encore pour vos encouragements et votre suivi !
Gwenaëlle, Isabelle, Yohan et Yoann pour l'ensemble de l'équipe bioinfo-fr.net

Opinion :
Les commandements du stagiaire en bioinformatique

La période des stages n'est pas loin et toi, jeune étudiant(e) bioinformaticien(ne) - futur(e) stagiaire, te demandes comment choisir parmi toutes ces annonces. Pas de panique, c'est tout à fait normal de se poser toute une ribambelle de questions, nous y sommes tous passés. La bonne nouvelle c'est que c'est ton jour de chance : les réponses se trouvent (normalement) dans ce billet.
À la recherche du stage : Motivation, mon amie

La première des choses à cocher dans ta checklist c'est la motivation...

Entretien :
Questions à... Marie Beurton Aimar

Retrouvez ici la retranscription de la première Table Ouverte en  BIonformatique (TOBi) organisée à Lyon le 16 mars 2017

Clément DELESTRE (CD) : Merci d'être présente pour ce premier TOBi à Lyon, est-ce que tu peux nous présenter ta formation, ton parcours, etc ?

Marie Beurton-Aimar (MBA) : On va rire là... Alors moi je suis informaticienne, un peu atypique parce que je suis allée à l'université tard, j'ai fait ma thèse tard ; j'ai passé ma thèse en 2000 donc il n'y a pas très longtemps, même si pour vous ça  parait peut-être loin...

Conférence :
Remise des diplômes du master BIG (Rennes)

Le 27 Novembre 2015 s'est déroulé le BIG-Day, c'est à dire la remise des diplômes du master Bio-informatique et Génomique de Rennes. Pour cette journée, les responsables du master ainsi que les membres de l'association locale E-Bigo ont décidé de marquer le coup. Plus de 8 heures avec les étudiants du master actuel, des anciens ainsi que les enseignants pour des conférences, des surprises, des posters...

Formation :
Présentation de la licence BISM (ex-MIV) à Lyon 1

[Article publié le 12 mars 2014 et mis à jour le 2 décembre 2015]
Présentation
La licence BISM (Bio-Informatique, Statistique et Modélisation), anciennement appelée MIV, est un parcours de spécialisation de la licence de Biologie, à l'université Claude Bernard Lyon 1. L’accent de la formation est mis à la fois sur la bioinformatique et sur l'analyse des données au sens large (modélisation et statistiques)...

Opinion :
Aux origines de la bioinformatique

Pour changer des tutoriels et des perspectives sur l’avenir de la bioinformatique, je vous propose aujourd’hui un retour aux sources. En effet, nous allons voir comment est née la bioinformatique. Nolwenn vous en avait déjà parlé ici, mais plus d'un point de vue méthodologique.
S’interroger sur les origines de la bioinformatique nous permettra de répondre (ou pas) à la question « Qu’est-ce que la bioinformatique ? » et nous amènera également à faire un peu de philosophie des sciences...

Formation :
Présentation du Master Bioinformatique & Génomique de Rennes

Présentation
Le Master Bioinformatique & Génomique (BIG) de l'Université de Rennes 1 a pris en 2013 la suite du Master Modélisation de Systèmes Biologiques (MSB). L’objectif principal de ce Master est de former des étudiants issus d’un cursus biologique, informatique ou mathématique aux besoins pluridisciplinaires en bio-informatique et en technologies à haut-débit de génomique fonctionnelle et post-génomique...

Brèves :
Former et se former en bioinformatique avec GOBLET !

Dans cet article, je vous présenterai un nouveau site qui peut être intéressant aussi bien pour les étudiants que pour les enseignants, voire également pour les bioinformaticiens déjà en fonction. Ici je ne vous noierai pas sous les lignes de code, mais je vous décrirai ce que le portail GOBLET vous propose en terme d'exercice. Prêts ? À vos claviers !
À propos de GOBLET
GOBLET, the Global Organisation for Bioinformatics Learning, Education and Training, est une fondation dont les mission sont, entre autres, de :

fournir un support global de formation à l'intention des étudiants et des formateurs en bioinformatique au travers d'un réseau structuré et stable ;
faciliter les capacités de développement en bioinformatique dans tous les pays ;
développer des standards et des guides pour la formation en bioinformatique...

Opinion :
De la nécessité d’une pratique collaborative en bioinformatique

Depuis l’avènement des algorithmes d’alignement de séquences jusqu’aux outils d’analyses de réseaux de protéines, la bioinformatique se cherche une définition et une place dans la science. Est-ce une discipline ? Est-ce un outil ? Quelle formation faut-il avoir pour être bioinformaticien ? Et à quoi ressemblerait idéalement un diplôme en bioinformatique ?
On sera tous d’accord qu’il n’y a pas une seule réponse à ces questions...