Étiquette : bioinformatique

  • Concours : Noël avant l'heure !

    Concours : Noël avant l'heure !

    A l'occasion de la sor­tie de notre fiche de lec­ture sur le livre "Pro­gram­ma­tion en Python pour les sciences de la vie" et sur une gen­tille pro­po­si­tion de Pierre Pou­lain & Patrick Fuchs, nous vous pro­po­sons un petit jeu concours avant Noël. Pour par­ti­ci­per : il y a dans le livre un petit eas­ter egg pla­cé…

  • L'intérêt d'une communauté scientifique bioinformatique

    L'intérêt d'une communauté scientifique bioinformatique

    "Tout seul on va plus vite, ensemble, on va plus loin". Pro­verbe afri­cain Il est un constat que je fais de plus en plus sou­vent et qui m'attriste à chaque fois un peu plus : notre belle socié­té semble tendre vers l'individualisme. Il est pro­bable que l'émergence des réseaux sociaux et à l'actuel culte du nom­bri­lisme…

  • Rentrée 2019/​2020, la bio-informatique de retour !

    Rentrée 2019/​2020, la bio-informatique de retour !

    Les bureaux sont à nou­veau pleins, les pro­jets arrivent en masse, l'IRC du blog se repeuple petit à petit avec des nou­velles têtes… Pas de doutes, c'est bien la ren­trée, et le site sort de sa tor­peur pour relan­cer la machine à articles autour de la bio­in­for­ma­tique ! On espère voir de nou­veaux auteurs se mani­fes­ter,…

  • Présentation du parcours de bio-informatique BIM à Nice

    Présentation du parcours de bio-informatique BIM à Nice

    Le par­cours bio-infor­ma­tique BIM existe en licence et en mas­ter, à Nice, depuis plus de 10 ans. À l'occasion de sa refonte en 2019, une petite pré­sen­ta­tion s'impose ! Présentation Le par­cours bio-infor­ma­tique BIM a pour objec­tif de for­mer des étu­diants ayant une for­ma­tion ini­tiale en bio­lo­gie et/​ou bio-infor­ma­tique aux approches de bio-infor­ma­tique, d'analyse de don­nées…

  • Trouver un emploi/​une thèse en bioinformatique : quelques pistes [maj]

    Trouver un emploi/​une thèse en bioinformatique : quelques pistes [maj]

    Comme le disait Estel en 2012, trou­ver un job en bioin­fo n'est pas évident. Contrai­re­ment à cer­tains métiers qui concentrent l'entièreté des offres d'emploi de leur pays en une seule pla­te­forme, les emplois de bioin­fo sont dis­tri­buées aléa­toi­re­ment entre des dizaines de sites d'annonces plus ou moins spé­ci­fiques à la bio­in­for­ma­tique. C'est pour­quoi l'article d'Estel…

  • BioinfoHoHoH !

    BioinfoHoHoH !

    Chère lec­trice, Cher lec­teur, Il est temps pour nous de te sou­hai­ter de bonnes fêtes de fin d'année. On va nous aus­si prendre un peu de recul pour reve­nir encore plus en forme ! On s'est d'ailleurs don­né pour mis­sion de séquen­cer le génome du bon­homme de neige. Pas une mince affaire ! On espère reve­nir l'année…

  • Du CV jusqu'au poster avec Inkscape (débutant)

    Du CV jusqu'au poster avec Inkscape (débutant)

    Nous revoi­là pour de nou­velles aven­tures sur Inks­cape ! Le but de ce tuto est moins de faire son CV avec Inks­cape, quand des outils qu’on uti­lise tous les jours le font très bien, que de se fami­lia­ri­ser avec un outil puis­sant en mani­pu­lant des notions de bases qui peuvent ser­vir ensuite notam­ment dans l’élaboration de…

  • Les grandes questions du doctorant en devenir/​débutant

    Les grandes questions du doctorant en devenir/​débutant

    … et ses "presque" réponses !   Dans cet article, je vais ten­ter de reprendre les grandes inter­ro­ga­tions que l'on peut avoir avant ou en com­men­çant sa thèse (voire même plus tard au cours de sa car­rière pour cer­taines) et plus par­ti­cu­liè­re­ment en bio­in­for­ma­tique (mais pas que). Si cer­taines seront très détaillées, d'autres res­te­ront plus éva­sives.…

  • ViLoVar : un outil pour la visualisation de variations génétiques

    ViLoVar : un outil pour la visualisation de variations génétiques

    Pour mon pre­mier article, je vais vous pré­sen­ter un outil que j'ai déve­lop­pé lorsque je tra­vaillais sur le pro­jet "Myo­cap­ture"; un pro­jet natio­nal de séquen­çage d'exomes qui por­tait sur les myo­pa­thies (https://​www​.afm​-tele​thon​.fr/​m​y​o​p​a​t​h​i​e​-​c​o​n​g​e​n​i​t​a​l​e​-​6​675). Ce pro­jet visait à trou­ver de nou­velles muta­tions res­pon­sables de ces mala­dies rares. Il a éga­le­ment per­mis d'identifier de nou­veaux gènes impli­qués dans…