Étiquette : statistiques

  • La première carte de la diversité génétique des poissons publiée

    La première carte de la diversité génétique des poissons publiée

    Introduction En ce début d’année 2020, notre équipe* a publié la pre­mière carte mon­diale de la diver­si­té géné­tique des pois­sons d’eau de mer et d’eau douce. C’est un ins­tru­ment impor­tant pour la pré­ser­va­tion des espèces. Cette pre­mière carte est publiée dans la revue Nature Com­mu­ni­ca­tions. Comme j’ai réa­li­sé l’ensemble des ana­lyses bio-infor­ma­tiques, je me suis…

  • Enquête Bioinfo-fr 2018 : un portrait de la bioinformatique

    Enquête Bioinfo-fr 2018 : un portrait de la bioinformatique

    Après 1 mois et demi d'enquête et 1 mois et demi d'attente, voi­ci donc l'article tant pro­mis qui va décor­ti­quer vos réponses !  Nous tenons par ailleurs à remer­cier tout les répon­dants qui ont don­né de leur temps et qui auront par­ta­gé ce son­dage dans leur entou­rage. Mer­ci d'avoir contri­bué à cette enquête. 🙂 L'intégralité des…

  • Julia : le successeur de R ?

    Julia : le successeur de R ?

    Actuel­le­ment le lan­gage R est incon­tour­nable pour qui veut mani­pu­ler des don­nées en bio­in­for­ma­tique, en par­ti­cu­lier pour l'analyse sta­tis­tique. Mais un suc­ces­seur est en passe de s'imposer : Julia, com­bi­nant puis­sance du lan­gage avec les fonc­tion­na­li­tés de R, et com­blant les nom­breux défauts de ce der­nier — mais plus encore ! Voi­ci une pré­sen­ta­tion de ce tout…

  • Tests Statistiques : suivez l'guide

    Tests Statistiques : suivez l'guide

    Introduction : Pourquoi des tests statistiques ? Les tests sta­tis­tiques sont de puis­sants outils d’aide à la déci­sion pour le cher­cheur, qui lui per­mettent de véri­fier des hypo­thèses expé­ri­men­tales, avec un cer­tain seuil de pro­ba­bi­li­té. Ces tests sont simples à appli­quer, mais par­fois moins simples à com­prendre. C’est pour­quoi nous allons étu­dier ensemble ces tests pas à pas…

  • L'analyse de données RNA-seq : mode d'emploi

    L'analyse de données RNA-seq : mode d'emploi

    Un jour, un bio­lo­giste se pointe chez vous avec d'une part un disque dur externe dans la main, d'autre part l'air sou­cieux. Il veut que vous ana­ly­siez ses don­nées RNA-seq. Le disque, c'est parce qu'il a envi­ron 50Gb de don­nées à vous trans­mettre ; l'air sou­cieux, c'est parce qu'elles ont coû­té dans les 15'000 euros, et…

  • J'ai lu : Statistiques pour statophobes

    J'ai lu : Statistiques pour statophobes

    Bon­jour à tous. J'aimerais par­ta­ger avec vous un ouvrage qui a chan­gé ma vie pro­fes­sion­nelle, à plu­sieurs niveaux. En lieu et place d'une intro­duc­tion, je vous offre quelques mor­ceaux choi­sis, avec les­quels mes talents de rédac­trice ne peuvent pas espé­rer lut­ter. Abs­tract : "Une intro­duc­tion au monde des tests sta­tis­tiques à l'intention des étu­diants qui n'y…

  • J’ai lu : Bioinformatique – Génomique et post-génomique

    J’ai lu : Bioinformatique – Génomique et post-génomique

    Suite à l'article de Guillaume, voi­ci le deuxième article de la rubrique J’ai lu, por­tant sur le livre « Bio­in­for­ma­tique – Géno­mique et post-géno­mique ». Bioinformatique – Génomique et post-génomique Ouvrage de Fré­dé­ric Dar­del et Fran­çois Képès, pro­fes­seurs à l'École poly­tech­nique, publié en 2002 aux Édi­tions École poly­tech­nique. Une par­tie de l’œuvre est dis­po­nible sur google docs. © Édi­tions École…

  • Bioconductor

    Bioconductor

    Bioconductor Voi­là le sujet que l'on va abor­der ensemble aujourd'hui. On va voir ce que c'est, à quoi cela sert, com­ment l'installer et bien-sûr l'utiliser. Qu'est-ce donc ? Je décri­rais Bio­con­duc­tor comme un pro­jet par­ti­ci­pa­tif. Il est libre d'accès et son déve­lop­pe­ment dépend de ce que la com­mu­nau­té veut bien y appor­ter. L'objectif est simple, offrir…

  • Revue de presse : Le printemps, les oiseaux et … la biblio

    Revue de presse : Le printemps, les oiseaux et … la biblio

    Je dois l'avouer : ce mois est un cau­che­mar. Il y avait une tonne de choses pas­sion­nantes ! Alors, le choix d'en lais­ser cer­tains en dehors m'a cau­sé des nuits blanches… Je plai­sante. J'en ai choi­si donc quelques-unes espé­rant que le mélange gour­mand et cro­quant fasse de l'ombre aux émis­sions culi­naires de M6 (clin d'oeil aux Gui­gnols).…