Auteur/autrice : waqueteu

waqueteu

Après une thèse de biochimie et un post-doc en chimiométrie pendant lesquels j'avais développé un certain nombre d'outils informatiques, j'ai décidé de sauter le pas et de devenir un bioinformaticien à part entière. A la suite d'une formation de bioinfo dispensée par l'institut Pasteur, j'ai intégré ce dernier comme bioinformaticien dans une unité de recherche sur l'ARN. Mon activité se répartit entre traitement et analyse de données d'une part et développement d'outils de bioinfo d'autre part.

Ses publications :

  • SARTools : l'analyse différentielle pour tous

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    waqueteu
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    SARTools : l'analyse différentielle pour tous

    Un article court aujourd’hui pour pré­sen­ter SAR­Tools, un outil d’analyse dif­fé­ren­tielle de don­nées de RNA-seq. Plus qu’un outil, SAR­Tools est plu­tôt un pipe­line sim­pli­fié pour trai­ter des don­nées d’analyses réa­li­sées dans un plan d’expérience assez basique. En effet le cadre d’utilisation de SAR­Tools est volon­tai­re­ment limi­té aux plans d’expérience simples, à savoir des com­pa­rai­sons de…

  • Le recrutement en bioinfo

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    waqueteu
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    Le recrutement en bioinfo

    Oncle Sam le dit : "I want you". Et il n'est pas le seul. En cette période de crise, le mar­ché de la bioin­fo se porte plu­tôt pas trop mal. Cela dit, il y a beau­coup de can­di­dats et on peut faci­le­ment pas­ser à coté d'une offre si on ne fait pas atten­tion à quelques détails.…

  • ECCB'14 à Strasbourg — le bilan

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    waqueteu
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    ECCB'14 à Strasbourg — le bilan

    ECCB'14 La confé­rence ECCB 2014 s’est dérou­lée cette année du 7 au 10 sep­tembre 2014 à Stras­bourg. Elle était cou­plée avec JOBIM et donc co-orga­ni­sée par la SFBI. La confé­rence était pré­cé­dée par 2 jour­nées de work­shops et tuto­riels. Le pro­gramme com­plet est acces­sible à l’adresse sui­vante : www​.eccb14​.org Les work­shops et tuto­riels en marge de la confé­rence…

  • Guide de démarrage pour ggplot2, un package graphique pour R

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    waqueteu
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    Guide de démarrage pour ggplot2, un package graphique pour R

    Le trai­te­ment et l’analyse de don­nées sont une part impor­tante des tâches deman­dées à un bio­in­for­ma­ti­cien. L’utilisation de R faci­lite gran­de­ment la mani­pu­la­tion des don­nées et per­met éga­le­ment leur repré­sen­ta­tion de mul­tiples façons. Mal­gré le poten­tiel de R, ce der­nier est sou­vent sous-exploi­té à cause d’une syn­taxe par­fois trop com­plexe. Je vais vous pré­sen­ter aujourd’hui…