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- Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012 -

Étiquette : github

  • Les mystérieuses cités d'or

    Les mystérieuses cités d'or

    La bio­in­for­ma­tique est un domaine de recherche donc, avec régu­liè­re­ment de nou­veaux logi­ciels et très souvent​​*​ votre pre­mier contact avec ce nou­veau logi­ciel se fait via la forge logi­ciel GitHub. Sur GitHub la pre­mière chose que l'utilisateur voit c'est le Readme (pour plus de détails sur ce fichier aller lire cet excellent billet de blog).…

  • Qu'est-ce qu'un bon fichier Lisez-moi.txt

    Qu'est-ce qu'un bon fichier Lisez-moi.txt

    Vous venez de finir votre outil sur lequel vous tra­vaillez depuis 1 semaine/​1 mois/​1 an/​10 ans (rayez la men­tion inutile) qui va révo­lu­tion­ner votre domaine. Votre code est ver­sion­né, for­ma­té, com­men­té, docu­men­té, tes­té, les résul­tats sont éva­lués selon le gold stan­dard de la dis­ci­pline sur des jeux de don­nées repré­sen­ta­tifs de la réa­li­té, votre publi­ca­tion…

  • Créez vos documents collaboratifs en LaTeX

    Créez vos documents collaboratifs en LaTeX

    Aujourd'hui, on vous pré­sente une méthode pour créer vos docu­ments col­la­bo­ra­tifs en ligne, en uti­li­sant LaTeX, ain­si que quelques astuces qui pour­ront peut-être vous sim­pli­fier la vie ! Un petit peu de contexte Ima­gi­nons : vous êtes un jeune cher­cheur dyna­mique, et vous vou­lez rédi­ger un papier avec vos col­la­bo­ra­teurs. Ou bien vous êtes un étu­diant, et…

  • S'outiller et s'organiser pour mieux travailler

    S'outiller et s'organiser pour mieux travailler

    TL;DR La repro­duc­ti­bi­li­té, c’est la vie (dans le monde scien­ti­fique) ! Tout résul­tat doit pou­voir être repro­duit. La tech­no­lo­gie per­met de faci­li­ter la recherche de repro­duc­ti­bi­li­té. Les cahiers de labo­ra­toire papiers ne sont plus du tout adap­tés à la recherche actuelle et au besoin de repro­duc­ti­bi­li­té. Je pré­co­nise donc d’utiliser git et GitHub, de bien…