Résultats de recherche pour « metagénomique »
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Métagénomique et Graphique de Recrutement : chercher l'aiguille dans la botte de foin !
Un intérêt certain se développe pour la compréhension d'écosystèmes complexes comme les eaux, les sols ou encore les microbiomes (plus de 90% des cellules du corps humain sont en fait les bactéries qui peuplent son tube digestif). Plusieurs difficultés se posent : la plupart des organismes présents ne sont pas facilement cultivables et donc individualisables. tous…
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La métagénomique et les défis pour la bioinformatique au goût #IHMC2012
On vous avait dit il y a peu qu'on allait vous parler du Congrès international sur le microbiome humain (International Human Microbiome Congress 2012). Pour quelques raisons, votre humble serviteure a tardé avec son forfait. Mais voici que c'est maintenant chose faite : nous espérons que la frustration sera vite oubliée 😉 Je vous avais déjà…
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Métagénomique : différences fondamentales avec la génomique
Qu'est ce que la métagénomique ? Depuis quelques années, la métagénomique semble s'installer de plus en plus parmi les sciences du vivant. Bien que plusieurs techniques et modi operandi se cachent derrière le terme "métagénomique", on peut y apposer une définition générale : la métagénomique vise à étudier l'ensemble des génomes issus d'un même milieu ainsi que…
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Métabarcodes de l'ADN environnemental
L'une des technologies en génomique les plus prometteuses pour l'évaluation de la biodiversité est le métabarcode (de l'anglais metabarcoding) de l'ADN environnemental (ADNe). J'ai travaillé longuement sur ces méthodes et développé plusieurs workflows pour traiter et analyser les données de métabarcodes. J'ai notamment été en charge du traitement des données génomiques récoltées par l’expédition scientifique…
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La bio-informatique au service de l’antibiorésistance
En ces temps hivernaux, virus et infections bactériennes sont de retour (pour vous jouer un mauvais tour…). Les campagnes de prévention et de soin sont donc de sortie, et parmi elles la célèbre : "Les antibiotiques, c'est pas automatique". Si ce slogan est bien rentré dans la tête des gens, la raison pour laquelle il a…
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Questions à… Laurent Mouchard
Avec un peu beaucoup de retard, retrouvez la retranscription de la TOBi organisée par JeBiF en mai 2016 avec Laurent Mouchard, maître de conférence à l'Université de Rouen et modérateur de la liste bioinfo. < p style="text-align : center;">Nous le remercions d'être venu nous raconter la petite histoire de la bioinformatique ! . Laurent Mouchard : Je suis vieux… J'ai…
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Le Master de Bordeaux s'internationalise !
Le Master Bioinformatique de Bordeaux propose à présent 3 parcours, dès la rentrée 2016–2017 : Le parcours "Biologie Computationnelle" est centré sur l'acquisition de compétences en développement logiciel et les méthodologies de gestion de données incluant la modélisation, la simulation de processus et l'analyse d'images biologiques. Le parcours "Du Génome aux Ecosystèmes" est focalisé sur l'utilisation…
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Questions à… Sophie Schbath
Ca y est ! Le concept des Tables Ouvertes en BioInformatique (TOBi), petit descendant des feus JeBiF Pub Paris, commence à bien s’implanter ! Un rapide rappel du concept pour les retardataires : tous les deuxièmes jeudi du mois au Café Six, retrouvez autour d'un verre l'association JeBiF et son invité du jour qui viendra présenter ses travaux, son…
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Montpellier OMICS Days 2016
Les 8 et 9 février dernier ont eu lieu à l'Université de Montpellier (UM) les 4e Montpellier OMICS Days (MODs). Un événement en deux temps : le premier jour était consacré aux conférences et le deuxième jour à 2 workshops un débutant sur la prise en main de l'environnement GNU/Linux et un avancé sur l'analyse des…