Résultat de la recherche pour: metagénomique

Découverte :
Métagénomique et Graphique de Recrutement : chercher l'aiguille dans la botte de foin !

Un intérêt certain se développe pour la compréhension d'écosystèmes complexes comme les eaux, les sols ou encore les microbiomes (plus de 90% des cellules du corps humain sont en fait les bactéries qui peuplent son tube digestif). Plusieurs difficultés se posent :

la plupart des organismes présents ne sont pas facilement cultivables et donc individualisables.
tous les organismes ne sont pas présents en quantité égale et, par extension, d'importance égale dans le fonctionnement de l'écosystème, sans corrélation stricte entre abondance et importance...

Conférence :
La métagénomique et les défis pour la bioinformatique au goût #IHMC2012

On vous avait dit il y a peu qu'on allait vous parler du Congrès international sur le microbiome humain (International Human Microbiome Congress 2012). Pour quelques raisons, votre humble serviteure a tardé avec son forfait. Mais voici que c'est maintenant chose faite : nous espérons que la frustration sera vite oubliée 😉
Je vous avais déjà présenté le Congrès, donc je ne le referai pas ici...

Découverte :
Métagénomique : différences fondamentales avec la génomique

La métagénomique ? késako ?
 Depuis quelques années, la métagénomique semble s'installer de plus en plus parmi les sciences du vivant. Bien que plusieurs techniques et modi operandi se cachent derrière le terme "métagénomique", on peut y apposer une définition générale : la métagénomique vise à étudier l'ensemble des génomes issus d'un même milieu ainsi que les interactions entre ces génomes...

Entretien :
Questions à… Laurent Mouchard

Avec un peu beaucoup de retard, retrouvez la retranscription de la TOBi organisée par JeBiF en mai 2016 avec Laurent Mouchard, maître de conférence à l'Université de Rouen et modérateur de la liste bioinfo.
Nous le remercions d'être venu nous raconter la petite histoire de la bioinformatique !

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Laurent Mouchard : Je suis vieux… J'ai donc eu le temps d'accumuler un parcours un peu particulier...

Formation :
Le Master de Bordeaux s'internationalise!

Le Master Bioinformatique de Bordeaux propose à présent 3 parcours, dès la rentrée 2016-2017:

Le parcours "Biologie Computationnelle" est centré sur l'acquisition de compétences en développement logiciel et les méthodologies de gestion de données incluant la modélisation, la simulation de processus et l'analyse d'images biologiques.
Le parcours "Du Génome aux Ecosystèmes" est focalisé sur l'utilisation avancée des logiciels de bioinformatique avec une spécialisation possible sur les applications moléculaire ("omics") et/ou environnementale (génétique des populations)...

Entretien :
Questions à… Sophie Schbath

Ca y est ! Le concept des Tables Ouvertes en BioInformatique (TOBi), petit descendant des feus JeBiF Pub Paris, commence à bien s’implanter ! Un rapide rappel du concept pour les retardataires : tous les deuxièmes jeudi du mois au Café Six, retrouvez autour d'un verre l'association JeBiF et son invité du jour qui viendra présenter ses travaux, son parcours, une technique, un institut, etc. Et qui répondra à toutes vos questions !
Les deux premières éditions ayant rencontré un franc succès, nous avons décidé avec nos chers admins de retranscrire ici le contenu de ces rencontres...

Conférence :
Montpellier OMICS Days 2016

Les 8 et 9 février dernier ont eu lieu à l'Université de Montpellier (UM) les 4e Montpellier OMICS Days (MODs). Un événement en deux temps : le premier jour était consacré aux conférences et le deuxième jour à 2 workshops un débutant sur la prise en main de l'environnement linux et un avancé sur l'analyse des données de NGS.
MODs 2016 : Analyse des données de séquençage à haut-débit (NGS) : Génomique, transcriptomique et analyses statistiques
Cet événement diffère un peu des autres : il est entièrement organisé par les étudiants du parcours « Bioinformatique, Connaissances, Données » (BCD) du Master Sciences & Numérique pour la Santé (SNS) et du Master « Statistiques pour les Sciences de la Vie » de l'UM, et encadré par Anna-Sophie Fiston-Lavier (Maitre de Conférence UM)...

Découverte :
Compareads et Commet

Après vous avoir parlé de Métagénomique et de filtre de Bloom, voici un article fusionnant les deux concepts en un algorithme !

Pour rappel, la métagénomique vise à étudier le contenu génétique et génomique d'un milieu donné. On passe généralement par un séquençage NGS et on récupère un grand nombre de courtes séquences d'ADN (lectures, ou "reads") pour chaque échantillon biologique analysé...

Conférence :
JOBIM 2015 : le bilan

Les Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques version 2015, organisées par l'Université d'Auvergne, se sont déroulées au Polydôme de Clermont-Ferrand du 6 au 9 juillet. Cette conférence était l'occasion de rassembler les communautés de diverses disciplines, dont la bioinformatique, la biomathématique et les biostatistiques. Les différents thèmes abordés étaient regroupés en sessions, chacune articulée autour d'un invité d'honneur...

Actualité :
La bière décodée dans un Hackuarium

Vous aimez la bière et la science ? Vous voulez connaître la composition de votre mousse favorite ? Vous avez envie de goûter de nouvelles bières proches de celles que vous connaissez, ou complètement différentes ?
Il y a quelques temps déjà, je vous ai décrit la place de la bioinformatique dans les laboratoires citoyens. Aujourd'hui, un projet sympathique de séquençage et d’analyse biochimique voit le jour à Renens (Suisse, VD)...