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- Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012 -

Catégorie : Découverte

  • Représenter le métabolisme — les réseaux métaboliques

    Représenter le métabolisme — les réseaux métaboliques

    *grosse voix très sérieuse* Atten­tion ! L'article qui suit est le pre­mier d'une série d'articles sur la repré­sen­ta­tion du méta­bo­lisme sous forme de réseaux et leur ana­lyse. Il existe, en bio­in­for­ma­tique, plu­sieurs caté­go­ries de modèles pour décrire le méta­bo­lisme.Tout d’abord, les modèles pour l’ana­lyse struc­tu­relle du méta­bo­lisme. Cette caté­go­rie regroupe prin­ci­pa­le­ment les modèles repo­sant sur la théo­rie…

  • Les dev' jam c'est bon pour vous !

    Les dev' jam c'est bon pour vous !

    Les tribulations de bioinformaticiens en territoire sarthois. Ou pourquoi les dev' jam, c'est le bien. Préambule glorieux. Bon­jour à tous ! Vous trou­ve­rez dans cet article (mon pre­mier sur inter­net <3) mon retour sur ma pre­mière dev' jam, et l'intérêt qu'il peut y avoir, en tant que bio­in­for­ma­ti­cien, à se rendre à un tel évè­ne­ment. Pour…

  • Snakemake pour les nuls (ou comment créer un pipeline facilement ?)

    Snakemake pour les nuls (ou comment créer un pipeline facilement ?)

    Bon­jour à tous, et bien­ve­nue dans le pre­mier épi­sode d'une (longue ?) série de prise en main de l'outil dédié au pipe­line : Sna­ke­make. Si vous ne connais­sez pas encore cet outil, c'est que vous êtes sûre­ment pas­sés à côté de cet article écrit par Nisaea. Alors, quel sera les béné­fices de retrans­crire vos pipe­lines déjà…

  • BIOASTER

    BIOASTER

    Le tour des labo­ra­toires pro­po­sant d'exercer notre métier de bio­in­for­ma­ti­cien conti­nue avec la pré­sen­ta­tion du tout jeune Ins­ti­tut de Tech­no­lo­gie en Micro­bio­lo­gie BIOASTER. Histoire et géographie BIOASTER ne s'est pas fon­dé en un jour et ne s'est sur­tout pas fon­dé tout seul. Par­mi le col­lège de fon­da­teurs qui a per­mis à cet ins­ti­tut de voir le…

  • Compareads et Commet

    Compareads et Commet

    Après vous avoir par­lé de Méta­gé­no­mique et de filtre de Bloom, voi­ci un article fusion­nant les deux concepts en un algo­rithme ! Pour rap­pel, la méta­gé­no­mique vise à étu­dier le conte­nu géné­tique et géno­mique d'un milieu don­né. On passe géné­ra­le­ment par un séquen­çage NGS et on récu­père un grand nombre de courtes séquences d'ADN (lec­tures, ou…

  • 3D XPoint : une nouvelle technologie de stockage

    3D XPoint : une nouvelle technologie de stockage

    Vous n'avez pas encore équi­pé votre ordi­na­teur de SSD ? Et bien vous pou­vez aban­don­ner le pro­jet… En effet Intel, en par­te­na­riat avec Micron, a pré­sen­té le 28 juillet une nou­velle tech­no­lo­gie de sto­ckage 3D XPoint (pro­non­cez trois dés ixe point three di cross point). 3D XPoint est bien plus rapide que le sto­ckage flash équi­pant les SSD, mais…

  • Vers une meilleure encryption des données génétiques

    Vers une meilleure encryption des données génétiques

    La démo­cra­ti­sa­tion du séquen­çage du génome humain, ouvrant les portes de la méde­cine per­son­na­li­sée, pro­voque aus­si beau­coup d'inquiétudes au sujet de la pro­tec­tion des don­nées. La séquence unique de l'ADN d'un indi­vi­du, en effet, peut indi­quer entre autres les pré­dis­po­si­tions à des mala­dies, la tolé­rance à diverses sub­stances, les traits poten­tiels de la des­cen­dance, le…

  • Twitter, arme de communication massive et outil scientifique

    Twitter, arme de communication massive et outil scientifique

    Twit­ter est un réseau social incon­tour­nable. Son prin­cipe est simple, il s'agit de s'échanger avec ses "fol­lo­wers", des mes­sages ou "tweets" de 140 cha­rac­tères maxi­mum. Il est sur­tout uti­li­sé aux Etats-Unis, mais la fièvre Twit­ter gagne peu à peu l'Europe.  De nom­breux scien­ti­fiques, chefs de labos, doc­to­rants et même des ins­ti­tu­tions informent par ce biais. En créant…