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Catégorie : Opinion

  • Généralité autour du concept de machine learning à partir d'automate

    Généralité autour du concept de machine learning à partir d'automate

    Pour beau­coup de per­sonnes, le machine lear­ning consiste à apprendre un clas­si­fieur de don­nées. Un exemple d'application prin­ci­pal serait d'être capable de dif­fé­ren­cier de manière auto­ma­tique plu­sieurs varié­tés d'iris selon la taille de leurs pétales. Mais selon moi, le machine lear­ning repré­sente beau­coup plus : c'est une science qui per­met d'expliquer à un ordi­na­teur com­ment réa­li­ser une tâche d'apprentissage…

  • État de l'emploi bioinformatique en France : analyse des offres de la SFBI

    État de l'emploi bioinformatique en France : analyse des offres de la SFBI

    Encore une nou­velle jour­née de code qui com­mence, j'ouvre ma boîte et… tiens donc, trois nou­velles annonces de la Socié­té Fran­çaise de Bio­In­for­ma­tique. Ça tombe bien, dans quelques mois je sou­tiens ma thèse, je devrais peut-être com­men­cer à cher­cher du bou­lot. Voyons voir ça… CDD déve­lop­peur web… Post-Doc déve­lop­peur logi­ciel… CDD Ingé­nieur déve­lop­pe­ment logi­ciel… Bon…

  • Les dev' jam c'est bon pour vous !

    Les dev' jam c'est bon pour vous !

    Les tribulations de bioinformaticiens en territoire sarthois. Ou pourquoi les dev' jam, c'est le bien. Préambule glorieux. Bon­jour à tous ! Vous trou­ve­rez dans cet article (mon pre­mier sur inter­net <3) mon retour sur ma pre­mière dev' jam, et l'intérêt qu'il peut y avoir, en tant que bio­in­for­ma­ti­cien, à se rendre à un tel évè­ne­ment. Pour…

  • Séquençage : pas de nouveauté depuis les années 70 ?

    Séquençage : pas de nouveauté depuis les années 70 ?

    Oui, on sait, vous les Gee­kus bio­lo­gi­cus vous avez du être atti­rés par ce titre en vous disant qu'on est com­plè­te­ment rava­gés. Évi­dem­ment qu'il y a de la nou­veau­té en matière de séquen­çage ! Appa­rem­ment tout le monde n'est pas au cou­rant. En effet, le 9 février, (au moins) deux articles, publiés dans des jour­naux grands…

  • Introduction sur les bonnes pratiques de développement

    Introduction sur les bonnes pratiques de développement

    Oyez Oyez jeune bio-infor­ma­ti­cien, étu­diant de mas­ter, pro­fes­sion­nel débu­tant ou autre curieux, cet article a été écrit spé­cia­le­ment pour vous par l'un des vôtres ! Pour tous les autres si cet article vous laisse un peu sur votre faim, je vous invite à lire deux autres billets déjà pré­sents sur le site, le pre­mier écrit par Nol­wenn,…

  • Aux origines de la bioinformatique

    Aux origines de la bioinformatique

    Pour chan­ger des tuto­riels et des pers­pec­tives sur l’avenir de la bio­in­for­ma­tique, je vous pro­pose aujourd’hui un retour aux sources. En effet, nous allons voir com­ment est née la bio­in­for­ma­tique. Nol­wenn vous en avait déjà par­lé ici, mais plus d'un point de vue métho­do­lo­gique. S’interroger sur les ori­gines de la bio­in­for­ma­tique nous per­met­tra de répondre (ou…

  • De la nécessité d’une pratique collaborative en bioinformatique

    De la nécessité d’une pratique collaborative en bioinformatique

    Depuis l’avènement des algo­rithmes d’alignement de séquences jusqu’aux outils d’analyses de réseaux de pro­téines, la bio­in­for­ma­tique se cherche une défi­ni­tion et une place dans la science. Est-ce une dis­ci­pline ? Est-ce un outil ? Quelle for­ma­tion faut-il avoir pour être bio­in­for­ma­ti­cien ? Et à quoi res­sem­ble­rait idéa­le­ment un diplôme en bio­in­for­ma­tique ? On sera tous d’accord qu’il n’y a…

  • Le recrutement en bioinfo

    Le recrutement en bioinfo

    Oncle Sam le dit : "I want you". Et il n'est pas le seul. En cette période de crise, le mar­ché de la bioin­fo se porte plu­tôt pas trop mal. Cela dit, il y a beau­coup de can­di­dats et on peut faci­le­ment pas­ser à coté d'une offre si on ne fait pas atten­tion à quelques détails.…

  • De l'explosion du tout séquençage à la médecine personnalisée

    De l'explosion du tout séquençage à la médecine personnalisée

    Un génome, c'est quoi ? Avant de plon­ger dans le vif du sujet, mieux vaut s'assurer qu'on ait les bases. Nous allons par­ler de séquen­çage de génome. Pour les notions sur le séquen­çage je vous redi­rige vers cet excellent article et pour le génome on va par­tir d'une défi­ni­tion simple et effi­cace : il s'agit de l'ensemble…