Archives par tags: Découverte

Découverte :
Les matrices de substitution

Dans les premiers billets de ce blog, nous avons présenté les alignements multiples de séquences d'une part du point de vue des logiciels et ensuite du calcul de la conservation. Je vous propose aujourd'hui de revenir sur un point important : les matrices de substitution.
by Roumpf (CC-by-SA 3.0)
Commençons par une définition très simple : une matrice de substitution permet, pour chaque acide aminé, de connaître sa capacité à être substitué par chaque autre acide aminé, y compris lui-même...

Découverte :
La modélisation moléculaire

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La modélisation moléculaire est un ensemble de méthodes permettant d'expliquer comment fonctionne le vivant. En effet, le vivant est une succession d’interactions entre différentes molécules : protéines, ADN, ARN, membranes, etc. Ces molécules interagissent les unes par rapport aux autres en fonction de plusieurs paramètres : leurs formes, leurs propriétés chimiques et leur environnement...

Découverte :
Bien commencer en bioinformatique

"Je n'y connais rien en informatique", "C'est trop compliqué pour moi" ou "Je ne sais pas par où commencer" sont des phrases qui nous servent souvent d'excuse pour ne pas nous lancer dans le grand bain de la bioinformatique. Biologiste de formation, j'ai moi-même à plusieurs reprises repoussé l'échéance avant de sauter, ne sachant comment m'y prendre ou voulant commencer directement par des choses trop complexes...

Découverte :
À la découverte de BioMart !

Dans le cadre de mon travail, j'ai récemment découvert un outil formidable pour la consultation et la récupération de données à partir de certaines banques : BioMart.
Logo de BioMart. Image du domaine public
Après avoir passé la frustration de devoir utiliser l'interface du service fourni pour télécharger les différentes données dont j'avais besoin, je me suis renseignée davantage sur ce logiciel...

Editorial :
Edito : Retour sur le mois d'avril

Bonjour à toutes et tous 🙂
Vous êtes toujours nombreux à nous visiter et nous vous en remercions ! Même si l'arrivée de nouveaux visiteurs a quelque peu baissé pendant le mois d'avril, le nombre de ceux qui reviennent sur le site a augmenté : nous avons donc des aficionados fidèles. Firefox et Chrome continuent à se partager pratiquement le gâteau navigateur, comptabilisant 56% et 33% des technologies, respectivement...

Découverte :
Métagénomique : différences fondamentales avec la génomique

La métagénomique ? késako ?
 Depuis quelques années, la métagénomique semble s'installer de plus en plus parmi les sciences du vivant. Bien que plusieurs techniques et modi operandi se cachent derrière le terme "métagénomique", on peut y apposer une définition générale : la métagénomique vise à étudier l'ensemble des génomes issus d'un même milieu ainsi que les interactions entre ces génomes...