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- Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012 -

Étiquette : Découverte

  • Monter un serveur de test pour des besoins d’analyses en bioinformatique

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    par

    Mica
    dans
    Monter un serveur de test pour des besoins d’analyses en bioinformatique

    Dans cet article je vais vous par­ler d'une facette un peu moins connue de la bio­in­for­ma­tique en vous pré­sen­tant com­ment il est pos­sible, à l'heure actuelle, d'assembler un ser­veur d’analyse bio­in­for­ma­tique avec un bud­get ser­ré. Il ne s'agit pas d'une étude de mar­ché très pous­sée mais d'un simple exemple du maté­riel qu'il est pos­sible d'utiliser pour réa­li­ser un ser­veur de déve­lop­pe­ment per­for­mant.…

  • Tester un système d'exploitation Unix

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    par

    Edward
    dans
    Tester un système d'exploitation Unix

    Un bio­lo­giste de pas­sage sur bioin​fo​-fr​.net pour­ra se deman­der com­ment tes­ter un sys­tème d'exploitation libre tel qu'Ubuntu, sachant qu'il a tou­jours tra­vaillé sous Win­dows©. Dans cet article, je donne quelques pos­si­bi­li­tés per­met­tant d'essayer gra­tui­te­ment ces sys­tèmes d'exploitations, et ce sans cham­bou­ler son ordi­na­teur et ses don­nées… Les expli­ca­tions sont acces­sibles à tous, mais s'adressent avant…

  • Les matrices de substitution

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    par

    Guillaume Collet
    dans
    Les matrices de substitution

    Dans les pre­miers billets de ce blog, nous avons pré­sen­té les ali­gne­ments mul­tiples de séquences d'une part du point de vue des logi­ciels et ensuite du cal­cul de la conser­va­tion. Je vous pro­pose aujourd'hui de reve­nir sur un point impor­tant : les matrices de sub­sti­tu­tion. Com­men­çons par une défi­ni­tion très simple : une matrice de sub­sti­tu­tion per­met,…

  • La modélisation moléculaire

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    par

    Gophys
    dans
    La modélisation moléculaire

    La modé­li­sa­tion molé­cu­laire est un ensemble de méthodes per­met­tant d'expliquer com­ment fonc­tionne le vivant. En effet, le vivant est une suc­ces­sion d’interactions entre dif­fé­rentes molé­cules : pro­téines, ADN, ARN, mem­branes, etc. Ces molé­cules inter­agissent les unes par rap­port aux autres en fonc­tion de plu­sieurs para­mètres : leurs formes, leurs pro­prié­tés chi­miques et leur envi­ron­ne­ment. La modé­li­sa­tion molé­cu­laire per­met de pré­dire la…

  • Bien commencer en bioinformatique

    —

    par

    Aurélien C.
    dans
    Bien commencer en bioinformatique

    "Je n'y connais rien en infor­ma­tique", "C'est trop com­pli­qué pour moi" ou "Je ne sais pas par où com­men­cer" sont des phrases qui nous servent sou­vent d'excuse pour ne pas nous lan­cer dans le grand bain de la bio­in­for­ma­tique. Bio­lo­giste de for­ma­tion, j'ai moi-même à plu­sieurs reprises repous­sé l'échéance avant de sau­ter, ne sachant com­ment…

  • À la découverte de BioMart !

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    par

    Nolwenn
    dans
    À la découverte de BioMart !

    Dans le cadre de mon tra­vail, j'ai récem­ment décou­vert un outil for­mi­dable pour la consul­ta­tion et la récu­pé­ra­tion de don­nées à par­tir de cer­taines banques : Bio­Mart. Après avoir pas­sé la frus­tra­tion de devoir uti­li­ser l'interface du ser­vice four­ni pour télé­char­ger les dif­fé­rentes don­nées dont j'avais besoin, je me suis ren­sei­gnée davan­tage sur ce logi­ciel. De…

  • Edito : Retour sur le mois d'avril

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    par

    Malicia
    dans
    Edito : Retour sur le mois d'avril

    Bon­jour à toutes et tous 🙂 Vous êtes tou­jours nom­breux à nous visi­ter et nous vous en remer­cions ! Même si l'arrivée de nou­veaux visi­teurs a quelque peu bais­sé pen­dant le mois d'avril, le nombre de ceux qui reviennent sur le site a aug­men­té : nous avons donc des afi­cio­na­dos fidèles. Fire­fox et Chrome conti­nuent à se…

  • Métagénomique : différences fondamentales avec la génomique

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    par

    Nico M.
    dans
    Métagénomique : différences fondamentales avec la génomique

    Qu'est ce que la métagénomique ?  Depuis quelques années, la méta­gé­no­mique semble s'installer de plus en plus par­mi les sciences du vivant. Bien que plu­sieurs tech­niques et modi ope­ran­di se cachent der­rière le terme "méta­gé­no­mique", on peut y appo­ser une défi­ni­tion géné­rale : la méta­gé­no­mique vise à étu­dier l'ensemble des génomes issus d'un même milieu ain­si que…