L'origine du projet :
Dans le cadre d'un projet tutoré du master de Bioinformatique de Rennes, nous avons mis en place un pipeline d'analyse des mails envoyés par la SFBI durant l'année 2014. Plusieurs modules ont été développés sous la forme de scripts Python, par un ou plusieurs étudiants. Je me chargeais de développer un module capable de générer des cartes à partir des données extraites des mails par d'autres modules...
Avec l’augmentation de la capacité des ordinateurs et de la qualité des algorithmes, l’informatique prend une place de plus en plus importante dans la vie de tous les jours, mais aussi dans la recherche. Cela est rendu aussi possible grâce à la programmation et aux améliorations des languages, des outils et des pratiques. Les développeurs sont devenus plus productifs.
Mais l’impact sur les scientifiques est plus mitigé...
Le Master Bioinformatique de Bordeaux propose à présent 3 parcours, dès la rentrée 2016-2017:
Le parcours "Biologie Computationnelle" est centré sur l'acquisition de compétences en développement logiciel et les méthodologies de gestion de données incluant la modélisation, la simulation de processus et l'analyse d'images biologiques.
Le parcours "Du Génome aux Ecosystèmes" est focalisé sur l'utilisation avancée des logiciels de bioinformatique avec une spécialisation possible sur les applications moléculaire ("omics") et/ou environnementale (génétique des populations)...
Le tirage au sort ayant été effectué par nos experts, nous sommes heureux d'annoncer que la place pour la formation de l'Institut Français de Bioinformatique, à savoir: IBI-1 - Utilisation de base du cloud IFB a été remportée par Julien Fumey !
Nous lui enverrons donc plus de précisions en privé dans la journée.
Bravo à lui et une bonne continuation à tous sur bioinfo-fr.net...
En partenariat avec l'Institut Français de Bioinformatique, nous vous proposons aujourd'hui de gagner votre place à la prochaine session de formation "Utilisation de base du cloud IFB" qui aura lieu le mardi 19 avril 2016. Le workshop aura lieu à Gif-sur-Yvette.
Le concours ne couvre pas le déplacement de l'heureux/se élu(e).
Le nombre de places par formation se limite à 20. Vous aurez donc l'honneur d'être l'un des heureux élus à pouvoir y participer si jamais vous êtes tiré au sort...
Le 27 Novembre 2015 s'est déroulé le BIG-Day, c'est à dire la remise des diplômes du master Bio-informatique et Génomique de Rennes. Pour cette journée, les responsables du master ainsi que les membres de l'association locale E-Bigo ont décidé de marquer le coup. Plus de 8 heures avec les étudiants du master actuel, des anciens ainsi que les enseignants pour des conférences, des surprises, des posters...
Le tour des laboratoires proposant d'exercer notre métier de bioinformaticien continue avec la présentation du tout jeune Institut de Technologie en Microbiologie BIOASTER.
Logo de BIOASTER
Histoire et géographie
BIOASTER ne s'est pas fondé en un jour et ne s'est surtout pas fondé tout seul. Parmi le collège de fondateurs qui a permis à cet institut de voir le jour fin 2012, on dénombre des laboratoires publics (INSERM, CEA, CNRS), l’Institut Pasteur (fondation privée) mais aussi des partenaires privés (Danone, Institut Mérieux, Sanofi-Pasteur)...
[Article publié le 12 mars 2014 et mis à jour le 2 décembre 2015]
Présentation
La licence BISM (Bio-Informatique, Statistique et Modélisation), anciennement appelée MIV, est un parcours de spécialisation de la licence de Biologie, à l'université Claude Bernard Lyon 1. L’accent de la formation est mis à la fois sur la bioinformatique et sur l'analyse des données au sens large (modélisation et statistiques)...
Présentation
Le Master Bioinformatique & Génomique (BIG) de l'Université de Rennes 1 a pris en 2013 la suite du Master Modélisation de Systèmes Biologiques (MSB). L’objectif principal de ce Master est de former des étudiants issus d’un cursus biologique, informatique ou mathématique aux besoins pluridisciplinaires en bio-informatique et en technologies à haut-débit de génomique fonctionnelle et post-génomique...
Logo titre de l'organisation GOBLEThttp://mygoblet.org/
Dans cet article, je vous présenterai un nouveau site qui peut être intéressant aussi bien pour les étudiants que pour les enseignants, voire également pour les bioinformaticiens déjà en fonction. Ici je ne vous noierai pas sous les lignes de code, mais je vous décrirai ce que le portail GOBLET vous propose en terme d'exercice. Prêts ? À vos claviers !
À propos de GOBLET
GOBLET, the Global Organisation for Bioinformatics Learning, Education and Training, est une fondation dont les mission sont, entre autres, de :
fournir un support global de formation à l'intention des étudiants et des formateurs en bioinformatique au travers d'un réseau structuré et stable ;
faciliter les capacités de développement en bioinformatique dans tous les pays ;
développer des standards et des guides pour la formation en bioinformatique...
