Étiquette : modélisation
-
IA et analyse des génomes : une autre révolution en cours ? (partie 2)
Si vous avez lu la partie 1 de cette série de trois articles, vous aurez compris que l'étude de l'article de présentation du modèle Evo2 (Brixi et al., 2025) nous aura littéralement enflammées au laboratoire 🤯. Le texte est à la fois dense et exigeant, mais il offre une contribution véritablement nouvelle au domaine. Ci-dessous,…
-
IA et analyse des génomes : une autre révolution en cours ? (partie 1)
Cher·es toutes et tous ! À chaque fois que je parcours ce blog, je me dis : « Ouah, c'est génial de prendre le temps, ainsi, de partager ses idées et ses savoir-faire, mais pourquoi est-ce que je ne le fais pas plus souvent ? ». Ma dernière (et unique !) contribution date en effet de 2021. Cela fait…
-
Introduction à la structure secondaire des ARN
Quand j'étais étudiante en master, la grande majorité des cours de structure étaient réservés aux protéines, ce qui fait que la structure des ARN n'a pas été très développée au cours de mon cursus. Du coup, je vous livre ici une partie de ce que j'ai appris en stage. Définition 0 : ARN L'ARN (acide ribonucléique) est…
-
Champs de force, énergie potentielle et autres joyeusetés en modélisation moléculaire
Introduction Cet article, d'une très longue série, a pour but de donner plus de détails et peut-être - qui sait - vous titiller suffisamment pour enjamber la barrière physique (au sens littéral) et rejoindre le fabuleux monde d'Oz de la bioinformatique structurale. Avant de commencer, je vous conseille de prendre du papier, un crayon, un…
-
Présentation de la licence BISM (ex-MIV) à Lyon 1
[Article publié le 12 mars 2014 et mis à jour le 2 décembre 2015] Présentation La licence BISM (Bio-Informatique, Statistique et Modélisation), anciennement appelée MIV, est un parcours de spécialisation de la licence de Biologie, à l'université Claude Bernard Lyon 1. L’accent de la formation est mis à la fois sur la bioinformatique et sur l'analyse…
-
Introduction aux systèmes multi-agents
Dans le monde merveilleux de l'intelligence artificielle, il existe une catégorie de systèmes de simulation inspirés de la nature et particulièrement adaptés à de nombreuses problématiques en biologie : les systèmes multi-agents. Ces systèmes sont composés d'entités autonomes (les agents) qui interagissent entre elles et avec un environnement dans lequel elles évoluent. Bien évidemment, l'inspiration "biologique"…
-
JOBIM2013 : le bilan
Ça y est, les JOBIM 2013 ont eu lieu. Cela se passait à Toulouse au Centre des Congrès Pierre Baudis. Ce fut une semaine bien chargée et bioinformatiquement très intéressante. Les sessions plénières ainsi que les parallèles ont rencontré un certain succès. Cette année les conférenciers invités étaient au nombre de six : Simon Anders (EMBL,…
-
GGMM 2013 : le bilan
Votre super reporter s'est rendu à deux congrès au mois de Mai, que vous avez pu suivre en direct via des live-tweets. Pour ceux qui ont raté le coche et pour les autre aussi, voici un résumé de ce qui s'est passé durant le premier congrès. GGMM, pour Groupe de Graphisme et Modélisation Moléculaire, est un congrès…