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- Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012 -

Étiquette : modélisation

  • Introduction à la structure secondaire des ARN

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    par

    Maria Pommeret
    dans
    Introduction à la structure secondaire des ARN

    Quand j'étais étu­diante en mas­ter, la grande majo­ri­té des cours de struc­ture étaient réser­vés aux pro­téines, ce qui fait que la struc­ture des ARN n'a pas été très déve­lop­pée au cours de mon cur­sus. Du coup, je vous livre ici une par­tie de ce que j'ai appris en stage. Défi­ni­tion 0 : ARN L'ARN (acide ribo­nu­cléique) est…

  • Champs de force, énergie potentielle et autres joyeusetés en modélisation moléculaire

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    par

    wj
    dans ,
    Champs de force, énergie potentielle et autres joyeusetés en modélisation moléculaire

    Introduction Cet article, d'une très longue série, a pour but de don­ner plus de détails et peut-être — qui sait — vous titiller suf­fi­sam­ment pour enjam­ber la bar­rière phy­sique (au sens lit­té­ral) et rejoindre le fabu­leux monde d'Oz de la bio­in­for­ma­tique struc­tu­rale. Avant de com­men­cer, je vous conseille de prendre du papier, un crayon, un…

  • Présentation de la licence BISM (ex-MIV) à Lyon 1

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    par

    marcbaillybechet
    dans
    Présentation de la licence BISM (ex-MIV) à Lyon 1

    [Article publié le 12 mars 2014 et mis à jour le 2 décembre 2015] Présentation La licence BISM (Bio-Infor­ma­tique, Sta­tis­tique et Modé­li­sa­tion), ancien­ne­ment appe­lée MIV, est un par­cours de spé­cia­li­sa­tion de la licence de Bio­lo­gie, à l'université Claude Ber­nard Lyon 1. L’accent de la for­ma­tion est mis à la fois sur la bio­in­for­ma­tique et sur l'analyse…

  • Introduction aux systèmes multi-agents

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    par

    François Vallée
    dans
    Introduction aux systèmes multi-agents

    Dans le monde mer­veilleux de l'intelligence arti­fi­cielle, il existe une caté­go­rie de sys­tèmes de simu­la­tion ins­pi­rés de la nature et par­ti­cu­liè­re­ment adap­tés à de nom­breuses pro­blé­ma­tiques en bio­lo­gie : les sys­tèmes mul­ti-agents. Ces sys­tèmes sont com­po­sés d'entités auto­nomes (les agents) qui inter­agissent entre elles et avec un envi­ron­ne­ment dans lequel elles évo­luent. Bien évi­dem­ment, l'inspiration "bio­lo­gique"…

  • JOBIM2013 : le bilan

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    par

    Article Collaboratif
    dans
    JOBIM2013 : le bilan

    Ça y est, les JOBIM 2013 ont eu lieu. Cela se pas­sait à Tou­louse au Centre des Congrès Pierre Bau­dis. Ce fut une semaine bien char­gée et bio­in­for­ma­ti­que­ment très inté­res­sante. Les ses­sions plé­nières ain­si que les paral­lèles ont ren­con­tré un cer­tain suc­cès. Cette année les confé­ren­ciers invi­tés étaient au nombre de six : Simon Anders (EMBL,…

  • GGMM 2013 : le bilan

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    par

    Gophys
    dans
    GGMM 2013 : le bilan

    Votre super repor­ter s'est ren­du à deux congrès au mois de Mai, que vous avez pu suivre en direct via des live-tweets. Pour ceux qui ont raté le coche et pour les autre aus­si, voi­ci un résu­mé de ce qui s'est pas­sé durant le pre­mier congrès. GGMM, pour Groupe de Gra­phisme et Modé­li­sa­tion Molé­cu­laire, est un congrès…

  • La modélisation moléculaire

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    par

    Gophys
    dans
    La modélisation moléculaire

    La modé­li­sa­tion molé­cu­laire est un ensemble de méthodes per­met­tant d'expliquer com­ment fonc­tionne le vivant. En effet, le vivant est une suc­ces­sion d’interactions entre dif­fé­rentes molé­cules : pro­téines, ADN, ARN, mem­branes, etc. Ces molé­cules inter­agissent les unes par rap­port aux autres en fonc­tion de plu­sieurs para­mètres : leurs formes, leurs pro­prié­tés chi­miques et leur envi­ron­ne­ment. La modé­li­sa­tion molé­cu­laire per­met de pré­dire la…