- Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012 -

Étiquette : programmation

  • Jouer avec l'API de KEGG

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    par

    Nolwenn
    dans
    Jouer avec l'API de KEGG

    Il n'est pas rare que nous ayons un jour besoin de récu­pé­rer des infor­ma­tions de la base de don­nées KEGG (Kyo­to Ency­clo­pe­dia of Genes and Genomes). Cette base de don­nées four­nit un nombre consé­quent d'informations sur les génomes et les réseaux de gènes mais éga­le­ment sur les voies méta­bo­liques ou les mala­dies. Dans ces cas…

  • Rust, un super héros au secours de la bio-informatique ?

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    par

    David Picard
    dans
    Rust, un super héros au secours de la bio-informatique ?

      Rust est la tra­duc­tion du mot "rouille" en anglais, ain­si qu'un jeu vidéo de sur­vie post-apo­ca­lyp­tique, mais c'est aus­si un lan­gage de pro­gram­ma­tion. Et vous devez main­te­nant vous deman­der : Encore un autre langage, mais pourquoi ? Les origines En 2006 Gray­don Hoare, un déve­lop­peur chez Mozilla, com­mence un pro­jet per­son­nel, un nou­veau lan­gage de pro­gram­ma­tion…

  • Software Carpentry ou la transmission de bonnes pratiques en informatique

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    par

    bebatut
    dans ,

    Avec l’augmentation de la capa­ci­té des ordi­na­teurs et de la qua­li­té des algo­rithmes, l’informatique prend une place de plus en plus impor­tante dans la vie de tous les jours, mais aus­si dans la recherche. Cela est ren­du aus­si pos­sible grâce à la pro­gram­ma­tion et aux amé­lio­ra­tions des lan­guages, des outils et des pra­tiques. Les déve­lop­peurs sont…

  • Écrire son parseur à la main — chroniques d'une mauvaise bonne idée

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    par

    Lucas Bourneuf
    dans
    Écrire son parseur à la main — chroniques d'une mauvaise bonne idée

    Partie 1 Où l'on prend conscience de l'existence de stan­dards, et de leur néces­si­té. Tout petit pro­gramme s'éveillant au monde se trou­ve­ra un jour face à ses obli­ga­tions : s’interfacer avec ce der­nier. La lumière exté­rieure devra alors péné­trer son petit antre, appor­tant mali­cieu­se­ment l'information de mille autres petits pro­grammes, si hété­ro­clites et désor­don­nés que nul…

  • Git : cloner un projet, travailler à plusieurs et créer des branches

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    par

    Article Collaboratif
    dans
    Git : cloner un projet, travailler à plusieurs et créer des branches

     Git est un logi­ciel de contrôle de ver­sions de fichiers. Il est dis­tri­bué sous licence GNU GPLv2 et est dis­po­nible sur les prin­ci­paux sys­tèmes d'exploitation. Dans l'article pré­cé­dent, nous avions vu com­ment ins­tal­ler et confi­gu­rer git, com­ment créer un dépôt pour un pro­jet, ain­si que les prin­cipes de base de ges­tion de ver­sions. Dans cet article,…

  • Gérer les versions de vos fichiers : premiers pas avec git

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    par

    Article Collaboratif
    dans ,
    Gérer les versions de vos fichiers : premiers pas avec git

    Git est un logi­ciel de contrôle de ver­sions de fichiers. Il est dis­tri­bué sous licence GNU GPLv2 et est dis­po­nible sur les prin­ci­paux sys­tèmes d'exploitation. Cet article est le pre­mier d'une série de deux. Nous allons voir ici (1) à quoi sert le contrôle de ver­sions, (2) com­ment confi­gu­rer git et (3) les bases de…