Étiquette : régulation

  • DNase-seq, FAIRE-seq, ChIP-seq, trois outils d'analyse de la régulation de l'expression des gènes

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    par

    I. Stévant
    dans
    DNase-seq, FAIRE-seq, ChIP-seq, trois outils d'analyse de la régulation de l'expression des gènes

    La régu­la­tion de la trans­crip­tion est un pro­ces­sus indis­pen­sable aux cel­lules pour per­mettre leur dif­fé­ren­cia­tion, expri­mer leur spé­ci­fi­ci­té, assu­rer leur déve­lop­pe­ment, leur pro­li­fé­ra­tion ou encore pour leur per­mettre de s'adapter à un envi­ron­ne­ment. L'étude de la régu­la­tion de la trans­crip­tion passe par l'identification d'éléments clés gou­ver­nant ces pro­ces­sus bio­lo­giques. Ces élé­ments de régu­la­tions se dis­tinguent…

  • Comment détecter, compiler et annoter des facteurs de transcription ?

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    par

    I. Stévant
    dans
    Comment détecter, compiler et annoter des facteurs de transcription ?

    Après la réunion de ren­trée de tous les contri­bu­teurs du blog, nous avons déci­dé d'étendre la rubrique "Jour­nal Club". Ain­si, il est désor­mais non seule­ment pos­sible mais aus­si for­te­ment recom­man­dé de pro­po­ser des billets dis­cu­tant d'un article en par­ti­cu­lier. Nous inau­gu­rons cette exten­sion avec un sujet pas­sion­nant : la détec­tion de fac­teurs de trans­crip­tion. Bonne lec­ture…

  • Étude de la régulation de l'épissage alternatif

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    par

    I. Stévant
    dans
    Étude de la régulation de l'épissage alternatif

    Je vais vous expo­ser dans cet articles un exemple de col­la­bo­ra­tion entre bio­lo­gistes et bio­in­for­ma­ti­ciens afin de répondre à un pro­blème bio­lo­gique com­plexe : l'étude de la régu­la­tion de l'épissage alter­na­tif. Je vais vous pré­sen­ter dans un pre­mier temps le contexte bio­lo­gique, à savoir ce qu'est l'épissage et com­ment il est régu­lé. Puis je vais vous…