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- Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012 -

Étiquette : visualisation de données

  • Contrarié par les diagrammes de Venn ? Découvrez les diagrammes UpSet

    Contrarié par les diagrammes de Venn ? Découvrez les diagrammes UpSet

    Titre incluant un moyen mné­mo­tech­nique ;D Avec ses cercles entre­croi­sés, on ne pré­sente plus le célèbre dia­gramme de Venn. Cette repré­sen­ta­tion est uti­li­sée dans le cas où l'on sou­haite repré­sen­ter le recou­pe­ment de don­nées de nombre fini selon plu­sieurs variables qua­li­ta­tives. De façon plus simple lorsqu'on a 2 variables qua­li­ta­tives : com­bien d'éléments pré­sents dans la…

  • Tour d'horizon des outils de visualisation des réseaux biologiques

    Tour d'horizon des outils de visualisation des réseaux biologiques

    Après les dif­fé­rentes méthodes d'analyse et de repré­sen­ta­tion de réseaux méta­bo­liques bio­lo­giques, je vais vous par­ler des dif­fé­rents outils de visua­li­sa­tion.  Car oui, la visua­li­sa­tion d'un réseau ou de ses sous-par­ties peut être le début de son ana­lyse, car elle per­met de se rendre compte de sa topo­lo­gie, de sa com­plexi­té, sa connec­ti­vi­té… En bio­lo­gie, on peut…

  • Ce qu'il faut voir sur une carte de contact chromosomique

    Ce qu'il faut voir sur une carte de contact chromosomique

    Vous ne connais­sez pas le Hi‑C ? Avant de com­men­cer cette lec­ture, peut être vous faut-il la base, pré­cé­dem­ment expli­quée (mal­adroi­te­ment certes, pre­mier article oblige) sur cet autre article. Sur la fin de mon stage de Mas­ter 2, j'ai eu la joie de reve­nir faire un tour dans les cartes de contacts chro­mo­so­miques (Hi‑C) pour diverses rai­sons.…

  • Guide de démarrage pour ggplot2, un package graphique pour R

    Guide de démarrage pour ggplot2, un package graphique pour R

    Le trai­te­ment et l’analyse de don­nées sont une part impor­tante des tâches deman­dées à un bio­in­for­ma­ti­cien. L’utilisation de R faci­lite gran­de­ment la mani­pu­la­tion des don­nées et per­met éga­le­ment leur repré­sen­ta­tion de mul­tiples façons. Mal­gré le poten­tiel de R, ce der­nier est sou­vent sous-exploi­té à cause d’une syn­taxe par­fois trop com­plexe. Je vais vous pré­sen­ter aujourd’hui…

  • Data Visualisation ou l'art de se faire comprendre

    Data Visualisation ou l'art de se faire comprendre

    De nos jours il faut com­prendre et se faire com­prendre vite et bien. Une bonne pré­sen­ta­tion, un bon article ou bien un bon pos­ter se dis­tingue non seule­ment par un conte­nu per­ti­nent mais aus­si par des illus­tra­tions effi­caces. On peut avoir la meilleure idée du monde, si on ne sait pas la mettre en valeur…