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- Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012 -

Étiquette : bioinformatique

  • De l’utilité (ou pas) d’une thèse en bioinformatique

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    par

    Estel
    dans
    De l’utilité (ou pas) d’une thèse en bioinformatique

    “Et pour­quoi pas une thèse ?” vous êtes-vous peut-être deman­dé en sor­tant du TD de sta­tis­tiques de mar­di der­nier. Pas for­cé­ment en bio­sta­tis­tiques, la thèse, hein. Mais la bio­in­for­ma­tique, ça vous parle vrai­ment. Vous ado­rez tra­vailler sur des pro­jets concrets, seul ou en groupe. Par contre, pour ce qui est de pen­ser à l’après-Master… Cer­tains…

  • Flux Balance Analysis ou la simulation du métabolisme d'une cellule

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    par

    Bunny
    dans
    Flux Balance Analysis ou la simulation du métabolisme d'une cellule

    "I thought there couldn't be any­thing as com­pli­ca­ted as the uni­verse, until I star­ted rea­ding about the cell.“ (Sys­tems Bio­lo­gist Eric de Sil­va -astro­phy­si­cist by trai­ning-, Impe­rial Col­lege Lon­don.) Avec l'arrivée des tech­no­lo­gies de séquen­çage à haut débit (NGS pour les intimes), de plus en plus de génomes com­plets sont dis­po­nibles dans les banques de don­nées…

  • Bioservices, un module Python très utile

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    par

    Nolwenn
    dans
    Bioservices, un module Python très utile

    Dans notre domaine si vaste, il existe de nom­breuses bases de don­nées (cf. Bases de don­nées, notions par nahoy), et par­mi ces bases, un cer­tain nombre d'entre elles pro­pose un ser­vice web pour accé­der à leurs don­nées à par­tir d'un script. Le pro­blème prin­ci­pal qui peut nous frei­ner, ou nous faire peur, lorsque l'on se…

  • ELIXIR, un savant mélange de pays

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    par

    max
    dans ,
    ELIXIR, un savant mélange de pays

    Vous avez peut-être enten­du par­ler d'ELIXIR récem­ment, car la France vient de rejoindre le pro­jet. Mais ELIXIR, c'est quoi ? Pour faire simple, ELIXIR c'est la réponse aux défis sui­vants, chers aux cher­cheurs en Science de la Vie : Ces défis étant jus­te­ment d'une por­tée trop vaste pour être géré par une seule ins­ti­tu­tion ou un seul…

  • J'ai lu : Bioinformatique, Cours et cas pratiques

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    par

    Guillaume Collet
    dans
    J'ai lu : Bioinformatique, Cours et cas pratiques

    Ce mois-ci, j'ai lu pour vous "Bioin­fo­ma­tique, Cours et cas pra­tique," un ouvrage de Gil­bert Deléage et Mano­lo Gouy, paru en 2013 aux édi­tions Dunod. Il s'agit d'un livre à des­ti­na­tion des étu­diants en licence et mas­ter qui sou­haitent décou­vrir la bio­in­for­ma­tique des pro­téines du point de vue du bio­lo­giste. C'est donc un ouvrage très…

  • Julia : le successeur de R ?

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    par

    Julien Delafontaine
    dans
    Julia : le successeur de R ?

    Actuel­le­ment le lan­gage R est incon­tour­nable pour qui veut mani­pu­ler des don­nées en bio­in­for­ma­tique, en par­ti­cu­lier pour l'analyse sta­tis­tique. Mais un suc­ces­seur est en passe de s'imposer : Julia, com­bi­nant puis­sance du lan­gage avec les fonc­tion­na­li­tés de R, et com­blant les nom­breux défauts de ce der­nier - mais plus encore ! Voi­ci une pré­sen­ta­tion de ce tout…

  • GGMM 2013 : le bilan

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    par

    Gophys
    dans
    GGMM 2013 : le bilan

    Votre super repor­ter s'est ren­du à deux congrès au mois de Mai, que vous avez pu suivre en direct via des live-tweets. Pour ceux qui ont raté le coche et pour les autre aus­si, voi­ci un résu­mé de ce qui s'est pas­sé durant le pre­mier congrès. GGMM, pour Groupe de Gra­phisme et Modé­li­sa­tion Molé­cu­laire, est un congrès…

  • Lâchez vos coms !

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    par

    Nisaea
    dans
    Lâchez vos coms !

    Je sou­hai­te­rais par­ta­ger avec vous dans ce billet quelques petites choses qui relèvent plus de l'anecdote per­son­nelle que de l'article sérieux. J'espère que vous ne m'en vou­drez pas si je prends le risque de bais­ser un peu le niveau de ce blog, mais ça fait un moment que le sujet me trot­tait en tête. Les…