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- Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012 -

Catégorie : Découverte

  • Métagénomique et Graphique de Recrutement : chercher l'aiguille dans la botte de foin !

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    par

    NiGoPol
    dans
    Métagénomique et Graphique de Recrutement : chercher l'aiguille dans la botte de foin !

    Un inté­rêt cer­tain se déve­loppe pour la com­pré­hen­sion d'écosystèmes com­plexes comme les eaux, les sols ou encore les micro­biomes (plus de 90% des cel­lules du corps humain sont en fait les bac­té­ries qui peuplent son tube diges­tif). Plu­sieurs dif­fi­cul­tés se posent : Face à une tâche aus­si ingrate que pas­sion­nante, les cher­cheurs ont trou­vé une solu­tion…

  • Comment organiser sa veille en Bioinformatique ?

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    par

    max
    dans

    Libre­ment tra­duit, com­plé­té et adap­té de l’article “How to Stay Cur­rent in Bioinformatics/​Genomics” par Ste­phen Tur­ner. Ste­phen est "assis­tant pro­fes­sor" (c'est à dire pro­fes­seur non encore titu­la­ri­sé) en san­té publique, et direc­teur du bio­in­for­ma­tics core de l'Université de Vir­gi­nie, et tient le blog Get­ting Things Done in Gene­tics & Bio­in­for­ma­tics Research. Plu­sieurs per­sonnes ayant deman­dé à Ste­phen com­ment il res­tait…

  • L'Encyclopédie ENCODE : coup de génie ou coup de pub ?

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    par

    Malicia
    dans ,
    L'Encyclopédie ENCODE : coup de génie ou coup de pub ?

    Vous avez pro­ba­ble­ment enten­du le buzz du web ou remar­qué la sou­daine aug­men­ta­tion d'articles autour du pro­jet ENCODE (déco­dage du génome humain et de ses élé­ments fonc­tion­nels). En 24 heures, il y a eu une quan­ti­té invrai­sem­blable de com­mu­ni­qués de presse, billets de blogs et articles grand public dans les médias anglo­phones (et je passe…

  • LaTeX, pour bien présenter et mettre en page

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    par

    Gophys
    dans
    LaTeX, pour bien présenter et mettre en page

    Brouillon

  • Introduction à l'analyse d'images

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    par

    Mica
    dans
    Introduction à l'analyse d'images

    Ce nou­vel article a pour but de don­ner une brève intro­duc­tion à l’analyse d’images numé­riques en bio­in­for­ma­tique. Je pré­fère pré­ve­nir tout de suite, je ne suis pas expert en la matière mais c’est un domaine que je trouve très inté­res­sant et dont il est tou­jours utile d’avoir quelques notions, pour retou­cher vos magni­fiques pho­tos de…

  • Les arbres phylogénétiques : construction et interprétation

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    par

    Yoann M.
    dans
    Les arbres phylogénétiques : construction et interprétation

    Après avoir dis­cu­té des ali­gne­ments mul­tiples (MSA), il s'avérait logique de vous pré­sen­ter l'étape sui­vante : la construc­tion d'arbres phy­lo­gé­né­tiques. Je pré­cise que je ne par­le­rai ici que de phy­lo­gé­nie molé­cu­laire. Le but de la phy­lo­gé­nie est de com­prendre les rela­tions de paren­té, de retra­cer l’historique évo­lu­tif d’un gène, d’une famille de gènes ou d’une espèce. Les…

  • La complétion de réseaux métaboliques

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    par

    Sylvain P.
    dans
    La complétion de réseaux métaboliques

    Il y a quelques temps, sur ce blog, j'ai publié un article qui par­lait de la recons­truc­tion auto­ma­tique de réseaux méta­bo­liques à par­tir d'un génome anno­té. Dans cet article je vous ai pro­mis de conti­nuer à par­ler de ce sujet, notam­ment pour voir com­ment l'on pou­vait amé­lio­rer la qua­li­té d'un réseau méta­bo­lique frai­che­ment créé. Pour…

  • Base de données - notions

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    par

    nahoy
    dans
    Base de données - notions

    Cet article a pour but d'introduire la notion de base de don­nées. Il sera utile pour toute per­sonne ayant déjà enten­du le terme, mais ne sachant pas vrai­ment ce que c'est, ou à quoi cela sert. Définition Une base de don­nées c'est tout sim­ple­ment une col­lec­tion d'informations diverses sto­ckées de manière pérenne sur un ordi­na­teur.…