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- Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012 -

Étiquette : Recherche

  • Concours CRCN-CNRS 2025

    Concours CRCN-CNRS 2025

    Comme tous les ans, le CNRS ouvre de nou­veaux postes per­ma­nents de char­gé de recherche au concours, et comme chaque année, la com­mu­ni­ca­tion autours du concours est une vraie nébu­leuse. D'après l'INS2I (branche sciences infor­ma­tiques du CNRS), la cam­pagne 2025 devrait s'ouvrir ce 9 décembre et se clô­tu­rer le 8 jan­vier 2025 : https://​www​.ins2i​.cnrs​.fr/​f​r​/​c​n​r​s​i​n​f​o​/​c​o​n​c​o​u​r​s​-​c​h​e​r​c​h​e​u​r​s​-​2​0​2​5​-​l​i​s​t​e​-​d​e​s​-​p​o​s​t​e​s​-​a​b​o​n​d​e​s​-​p​a​r​-​c​n​r​s​-​s​c​i​e​n​c​e​s​-​i​n​f​o​r​m​a​t​i​q​ues Il s'agit…

  • Les pièges mentaux à éviter pour les plus jeunes chercheurs

    Les pièges mentaux à éviter pour les plus jeunes chercheurs

    Aujourd'hui, j'aimerais expri­mer une opi­nion que je ne vois pas et qui fait suite à quelques conseils don­nées aux doc­to­rants dans ce blog. Ce mes­sage s'adresse à tous, dans une com­mu­nau­té à laquelle je n'appartiens plus vrai­ment n'étant plus dans l'académique. Nous évo­que­rons ici cer­tains cli­chés que j'ai enten­du. Un jour on est jeune, on…

  • Ne devenez pas un dinosaures : adoptez un copilot !

    Ne devenez pas un dinosaures : adoptez un copilot !

    Sauf si vous vivez dans une grotte, sur une pla­nète sans ordi­na­teur ni télé­vi­sion, le terme ChatGPT doit main­te­nant réson­ner à vos oreilles comme le der­nier jouet à la mode. Après avoir fait des ravages consi­dé­rables dans le domaine du trai­te­ment du lan­gage, de l'imagerie et de nom­breux autres domaines, le Deep Lear­ning est en…

  • Covid-19 : Des liens utiles pour aider à la recherche contre le SARS-CoV‑2

    Covid-19 : Des liens utiles pour aider à la recherche contre le SARS-CoV‑2

    Pen­dant cette pan­dé­mie du Covid-19, bon nombre de per­son­nel scien­ti­fique vou­drait pou­voir appor­ter un peu d'aide. Voi­ci une liste des liens qui nous sont par­ve­nus. Covid-19 est la mala­die cau­sée par le virus SARS-CoV2, vous ver­rez appa­raître ces deux termes dans les liens ci-bas. De l'aide à la recherche Crowd Fight Covid19 : Des scien­ti­fiques demandent…

  • La première carte de la diversité génétique des poissons publiée

    La première carte de la diversité génétique des poissons publiée

    Introduction En ce début d’année 2020, notre équipe* a publié la pre­mière carte mon­diale de la diver­si­té géné­tique des pois­sons d’eau de mer et d’eau douce. C’est un ins­tru­ment impor­tant pour la pré­ser­va­tion des espèces. Cette pre­mière carte est publiée dans la revue Nature Com­mu­ni­ca­tions. Comme j’ai réa­li­sé l’ensemble des ana­lyses bio-infor­ma­tiques, je me suis…

  • Le déclin (relatif) de la production bioinformatique française

    Le déclin (relatif) de la production bioinformatique française

    L’idée de cet article vient d’une étude réa­li­sée en 2008 par Jean Lobry, Pro­fes­seur à l’Université Claude Ber­nard – Lyon 1, ceci dans le cadre de ses ensei­gne­ments en bio­in­for­ma­tique (plus exac­te­ment ses TD sur le lan­gage R). Mon objec­tif était de regar­der la dyna­mique de publi­ca­tion de la France dans le domaine de la…

  • Les grandes questions du doctorant en devenir/​débutant

    Les grandes questions du doctorant en devenir/​débutant

    … et ses "presque" réponses ! Dans cet article, je vais ten­ter de reprendre les grandes inter­ro­ga­tions que l'on peut avoir avant ou en com­men­çant sa thèse (voire même plus tard au cours de sa car­rière pour cer­taines) et plus par­ti­cu­liè­re­ment en bio­in­for­ma­tique (mais pas que). Si cer­taines seront très détaillées, d'autres res­te­ront plus éva­sives. Cela…

  • Formaliser ses protocoles avec Snakemake

    Formaliser ses protocoles avec Snakemake

    Vous avez dit protocole ? Qui dit bio­lo­gie et bio­in­for­ma­tique dit pro­to­cole expé­ri­men­tal. C'est le cœur de la démarche scien­ti­fique, et un for­ma­lisme adap­té est la clef pour assu­rer la repro­duc­ti­bi­li­té des expé­riences, et ain­si garan­tir la vali­da­tion des décou­vertes par la com­mu­nau­té. En paillasse, les solu­tions pour for­ma­li­ser et conser­ver les pro­to­coles sont plu­tôt natu­rel­le­ment…