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  • Synchronisez vos PDF Zotero sur Android

    Synchronisez vos PDF Zotero sur Android

    Après un an d'errance, j'ai enfin réus­si à syn­chro­ni­ser ma col­lec­tion d'articles en PDF entre mon pc et ma liseuse, et sur­tout les anno­ta­tions faites depuis ma liseuse. Bon, j'avais lâché l'affaire pen­dant long­temps, mais un mes­sage de @sebgra sur notre ser­veur Dis­cord m'a fait remettre les mains dans le cam­bouis. Comme vous le savez,…

  • IA et bioinformatique : exploitons les réseaux convolutionnels (CNN)

    IA et bioinformatique : exploitons les réseaux convolutionnels (CNN)

    Inter­es­sons-nous aujourd'hui aux séquences d’ADN. Nous uti­li­se­rons le data­set télé­char­geable ici : https://​www​.kaggle​.com/​d​a​t​a​s​e​t​s​/​n​a​g​e​s​h​s​i​n​g​h​/​d​n​a​-​s​e​q​u​e​n​c​e​-​d​a​t​a​set L'ensemble des fichiers néces­saire à cet article sont dis­po­nibles ici. Vous trou­ve­rez dans ce lot de don­nées un ensemble de séquences d’ADN issues de 3 espèces : l’homme, le chien et le chim­pan­zé. Cha­cune de ces séquences appar­tient à une des 7 familles de…

  • Licence double "Informatique — Sciences de la vie" à Évry

    Licence double "Informatique — Sciences de la vie" à Évry

    La licence double Infor­ma­tique — Sciences de la vie est une for­ma­tion double diplôme de l'Université Paris — Saclay dis­pen­sée à la fois à l'Université de Ver­sailles Saint-Quen­tin et à l'Université d'Évry val d'Essonne. Cette for­ma­tion en trois ans vise à appor­ter aux étu­diants des com­pé­tences solides dans les deux domaines que sont la bio­lo­gie…

  • Qu'est-ce que la toxicogénomique ?

    Qu'est-ce que la toxicogénomique ?

    Oyez, oyez humble lec­teur, aujourd'hui je vous pro­pose de par­tir en voyage dans le monde de la toxi­co­lo­gie. À quoi peut bien ser­vir les don­nées OMICS pour un toxi­co­logue ? Hé bien, à faire de la toxi­co­gé­no­mique par­di ! Dans ce billet je vous pro­pose une petite porte sur ce domaine d'application des omics et de se…

  • Bonnes fêtes de fin d'année !

    Bonnes fêtes de fin d'année !

    Chers bioin­fo-freurs et bioin­fo-freuses, nous vous sou­hai­tons de très bonne fêtes ! Que cette fin d'année soit aus­si douce et agréable qu'une bonne tasse de cho­co­lat chaud au coin du feu. De nôtre côté, nous disons au revoir avec la lar­mi­chette à l'oeil à notre co-fon­da­teur et admi­nis­tra­teur his­to­rique Yoann Mous­caz, qui part voguer sous d'autres…

  • Pourquoi je ne lis pas tous les CVs de la même manière

    Pourquoi je ne lis pas tous les CVs de la même manière

    Dans un pré­cé­dent billet je me suis lais­sé vaga­bon­der autour de l'idée qu'un bio­in­for­ma­ti­cien était un data truc comme un autre. Dans ces lignes je vais expri­mer pour­quoi il est impor­tant à mon sens de bien tra­vailler son CV… et ce qui per­son­nel­le­ment me fait réflé­chir sur la forme de CV liée à nos métiers.…

  • Les mystérieuses cités d'or

    Les mystérieuses cités d'or

    La bio­in­for­ma­tique est un domaine de recherche donc, avec régu­liè­re­ment de nou­veaux logi­ciels et très souvent​​*​ votre pre­mier contact avec ce nou­veau logi­ciel se fait via la forge logi­ciel GitHub. Sur GitHub la pre­mière chose que l'utilisateur voit c'est le Readme (pour plus de détails sur ce fichier aller lire cet excellent billet de blog).…

  • Bioinformatique et IA : un premier pas

    Bioinformatique et IA : un premier pas

    Intelligence Artificielle, Machine Learning, Deep-Learning, quid du Data-Scientist Intel­li­gence arti­fi­cielle (IA), Machine lear­ning (Appren­tis­sage machine, pour les fran­co­phones), Deep-lear­ning (Appren­tis­sage pro­fond), autant de termes si étran­gers et fami­liers à la fois… Com­ment se retrou­ver dans cette jungle de termes tech­niques ? Com­men­çons par défi­nir ce qu'est l'IA. Base de science-fic­tion pour cer­tains, source d'inquiétudes pour d'autres,…

  • De bioinformaticien à data scientist, un simple pas ?

    De bioinformaticien à data scientist, un simple pas ?

    Nom­breux par­mi nous se retrouvent un jour en fin de master/​thèse ou post­doc de bio­in­for­ma­tique. A ce moment là, dans les dif­fi­cul­tés de la recherche d'emplois on vient à se deman­der : "Et si je pos­tu­lais à toutes ces offres de data scien­tist ?"Dans ces lignes, je vais don­ner mon avis de manière libre, sur pour­quoi…