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R : représenter des genomic tracks avec Gviz
Lire la suite : R : représenter des genomic tracks avec GvizSi vous analysez des données d'épigénomique telles que de l'ATAC-seq ou des ChIP-seq, vous souhaitez sûrement pouvoir représenter des exemples de pics sous forme de genomic tracks comme on en voit souvent dans les publications. Lorsque l'on inspecte ses données de coverage (ou couverture), on charge généralement le fichier Bam ou le fichier BigWig dans […]
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Appel à contribution
Lire la suite : Appel à contributionVous étiez nombreux à JOBIM 2024 à nous écouter présenter Bioinfo-fr et à vous inscrire sur notre serveur Discord. Merci à vous, et nous espérons que vous passerez de bons moments et que vous trouverez toute l'aide dont vous avez besoin, que ce soit sur le blog ou sur les réseaux. Dans le but de […]
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Les Bioinformations n°38 sont là !
Lire la suite : Les Bioinformations n°38 sont là !Quelles sont les dernières actualités des communautés françaises de bioinformatique ? Vous saurez tout dans ce nouveau numéro des Bioinformations : https://www.bioinformations.fr C'est quoi déjà les Bioinformations ? Il s'agit d'une newsletter trimestrielle créée en 2012, à l'initiative de la Société Française de Bioinformatique (SFBI), l'association de Jeunes Bioinformaticiens de France (JeBiF) et nous-mêmes, le blog collaboratif Bioinfo-fr.net, […]
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Coder sous Windows avec WSL2
Lire la suite : Coder sous Windows avec WSL2Quand on n'a pas le choix que de coder sous Windows alors qu'on aimerait pouvoir coder sous Unix/Linux, peu d'offres sont disponibles pour développer dans des conditions correctes. Il y en a globalement 2 : soit on crée une machine virtuelle qui fait tourner son OS préféré (ce qui consomme pas mal de ressources du PC […]
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Caricature de la bioinformatique pour mon collègue IT
Lire la suite : Caricature de la bioinformatique pour mon collègue ITCe blog n'est pas toujours lisible pour ma mère. Ce blog n'est pas lisible pour mes grands-parents, mais surtout, il ne l'est pas pour toi, mon collègue informaticien. Toi qui ne me comprends pas quand je te dis que je travaille sur des données de grande dimension et qui imagines des images ou du texte. […]
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Synchronisez vos PDF Zotero sur Android
Lire la suite : Synchronisez vos PDF Zotero sur Android[Update 06/2024] Une application Android officielle est en Bêta Test : https://play.google.com/store/apps/details?id=org.zotero.android&hl=fr Après un an d'errance, j'ai enfin réussi à synchroniser ma collection d'articles en PDF entre mon pc et ma liseuse, et surtout les annotations faites depuis ma liseuse. Bon, j'avais lâché l'affaire pendant longtemps, mais un message de @sebgra sur notre serveur Discord m'a […]
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IA et bioinformatique : exploitons les réseaux convolutionnels (CNN)
Lire la suite : IA et bioinformatique : exploitons les réseaux convolutionnels (CNN)Interessons-nous aujourd'hui aux séquences d’ADN. Nous utiliserons le dataset téléchargeable ici : https://www.kaggle.com/datasets/nageshsingh/dna-sequence-dataset L'ensemble des fichiers nécessaire à cet article sont disponibles ici. Vous trouverez dans ce lot de données un ensemble de séquences d’ADN issues de 3 espèces : l’homme, le chien et le chimpanzé. Chacune de ces séquences appartient à une des 7 familles de […]
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Licence double "Informatique — Sciences de la vie" à Évry
Lire la suite : Licence double "Informatique — Sciences de la vie" à ÉvryLa licence double Informatique — Sciences de la vie est une formation double diplôme de l'Université Paris — Saclay dispensée à la fois à l'Université de Versailles Saint-Quentin et à l'Université d'Évry val d'Essonne. Cette formation en trois ans vise à apporter aux étudiants des compétences solides dans les deux domaines que sont la biologie […]
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